在上一篇中,我已经讲解了展示marker基因的前两种图形,分别是tsne/umap图.热图,感兴趣的读者可以回顾一下.这一节我们继续学习堆叠小提琴图和气泡图. 3. 堆叠小提琴图展示marker基因 相比于其他可视化形式,小提琴图可以更直观地展示某一类亚群的某一个基因的表达分布情况.我的marker基因一共选了12个,下面来画图: Seurat内置的VlnPlot函数可以直接画, library(xlsx) markerdf2=read.xlsx("ref_marker2.xlsx",

今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图:tsne/umap图.热图.堆叠小提琴图.气泡图,每个图我都会用两种方法绘制. 使用的数据来自文献:Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune cell diversity and immune subtypes associated with prognosis in nasopharyngeal carcinoma. 去年7月发表在Cell Re

箱线图 箱线图是能同时反映数据统计量和整体分布,又很漂亮的展示图.在2014年的Nature Method上有2篇Correspondence论述了使用箱线图的好处和一个在线绘制箱线图的工具.就这样都可以发两篇Nature method,没天理,但也说明了箱线图的重要意义.   下面这张图展示了Bar plot.Box plot.Volin plot和Bean plot对数据分布的反应.从Bar plot上只能看到数据标准差或标准误不同:Box plot可以看到数据分布的集中性不同:Violin

一.散点图stripplot( ) 与swarmplot() 1.分类散点图stripplot( ) 用法stripplot(x=None, y=None, hue=None, data=None, order=None, hue_order=None,jitter=True, dodge=False, orient=None,   color=None, palette=None,size=5, edgecolor="gray", linewidth=0, ax=None, **kw

1. 分类数据可视化 - 分类散点图 stripplot( ) / swarmplot( ) sns.stripplot(x="day",y="total_bill",data=tips,jitter = True, size = 5, edgecolor = 'w',linewidth=1,marker = 'o') import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt imp

我们不止可以读取数据库的内容,还可以读取xlsx文件的内容,这个库有在有些情况还是挺实用的 首先我们想读取这个文件的时候必须得现有个seaborn库 下载命令就是: pip install  seaborn 我写了个案例, 就是把读取的内容在小提琴图上显示出来,还有在对比柱形图上显示出来   #导报 import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns if __n

import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns # 设置风格,seaborn有5种基本风格,context表示环境 sns.set(style="white", context="notebook") # 处理中文问题 sns.set_style('whitegrid', {'font.sans-serif':['simhei',

原理 使用一个默认颜色为透明的,并且只显示labelLine的饼状图 然后通过调节这个透明的饼状图 以达到修改labelLine的位置 echarts地址 https://gallery.echartsjs.com/editor.html?c=x6VnXPfxlx echarts源码: option = { backgroundColor: "#03141c", title: { text: "84%", subtext: '完成部门占比', x: 'center'

1,函数stipplot() stipplot()函数用来画散点图,其x轴是离散型的变量 直接上代码 import seaborn as sns import numpy as np import pandas as pd import matplotlib as mpl import matplotlib.pyplot as plt tips = sns.load_dataset("tips") #seaborn内置数据集,DaraFram类型 sns.stripplot(x=&qu

html { font-family: sans-serif; -ms-text-size-adjust: 100%; -webkit-text-size-adjust: 100% } body { margin: 0 } article, aside, details, figcaption, figure, footer, header, hgroup, main, menu, nav, section, summary { display: block } audio, canvas, p

前言 无论使用哪种语言,都离不开面向过程与面向对象两个流派,而类图是面向对象程序设计中至关重要的一种软件表达形式,如何看懂类图,并设计好的软件架构,是我们作为软件工程师必不可少的技能之一. 今天小黑把类图学习的一些笔记和心得分享出来,供大家参考. 什么是类 了解类图之前,我们需要简单了解一下类的概念 类(Class)封装了数据和行为,是面向对象的重要组成部分,它是具有相同属性.操作.关系的对象集合的总称. 在面向过程设计中,数据和算法组织成为程序.而面向对象中,数据+算法的理论基础并没有改变,虽

如何看懂类图 1.类图简介 描述类的内部结构和类与类之间的关系,是一种静态结构图. 在UML类图中,常见的有以下几种关系: 泛化(Generalization),  实现(Realization),关联(Association),聚合(Aggregation),组合(Composition),依赖(Dependency). 2.各种关系的强弱顺序 泛化 = 实现 > 组合 > 聚合 > 关联 > 依赖 3.类图关系 3.1.泛化 表示继承关系, 表示类/接口对父类/接口的功能扩展.

啥也不说了,实战java虚拟机,好好学习,天天向上!针对自己的软肋制定学习计划. 一部分内容看完,自己做的学习笔记和感想. 学java很简单,但懂java会有难度,如果你的工资还没超过1W,那是时候深入学习一下子了.    边学习边奉上5篇笔记 实战Java虚拟机之一“堆溢出处理” 实战Java虚拟机之二“虚拟机的工作模式” 实战Java虚拟机之三“G1的新生代GC” 实战Java虚拟机之四“禁用System.gc()” 实战Java虚拟机之五“开启JIT编译”  <实战Java虚拟机>一书的

Given two words (start and end), and a dictionary, find all shortest transformation sequence(s) from start to end, such that: Only one letter can be changed at a time Each intermediate word must exist in the dictionary For example, Given:start = "hit

以下数据由Fancier凡奉信息根据历年CMMI Institute公布的CMMI评估结果的汇总整理.数据跨度2008-2017年,包含对中国CMMI与全球CMMI的不同等级.版本的统计.

ZERO WIDTH SPACE 由于历史原因,编码方案中保留着该类编码 解决方案 1. 替换 ```js str.replace(/[\u200B-\u200D\uFEFF]/g, ''); ``` 2. 另一种替换 ```js str.replace(/\u8203/g, ''); str.replace(/\uB200/g''); ``` 3. 还有一种替换 ```js str.replace(/(^[\s\u200b]*|[\s\u200b]*$)/g, '') ``` 4. 也可以先获

覆盖物,是一张地图的灵魂.有覆盖物的地图.才是完整的地图.在一张地图上,除了底层的底图(瓦片图,矢量图),控件(有功能可操作的工具).最重要最必不可少的就是覆盖物了.覆盖物有多种.包含.标注.折线.多边形.信息窗体.聚合marker.麻点图和图片覆盖物. 本文会具体介绍每一种覆盖物的概念.加入方法,改动方法.移除方法等.最后会提供演示样例和源码下载. 演示样例demo:http://zhaoziang.com/amap/zero_3_1.html ------------------------

原文:[高德地图API]从零开始学高德JS API(三)覆盖物——标注|折线|多边形|信息窗口|聚合marker|麻点图|图片覆盖物 摘要:覆盖物,是一张地图的灵魂.有覆盖物的地图,才是完整的地图.在一张地图上,除了底层的底图(瓦片图,矢量图),控件(有功能可操作的工具),最重要最不可缺少的就是覆盖物了.覆盖物有多种,包括,标注.折线.多边形.信息窗口.聚合marker.麻点图和图片覆盖物.本文会详细介绍每一种覆盖物的概念,添加方法,修改方法,移除方法等.最后会提供示例和源代码下载. 示例dem

出处:http://blog.chinaunix.net/uid-28852942-id-3992727.html这篇文章不是介绍 nand flash的物理结构和关于nand flash的一些基本知识的.你需要至少了解 你手上的 nand flash的物理结构和一些诸如读写命令 操作的大概印象,你至少也需要看过 s3c2440中关于nand flash控制寄存器的说明. 由于本人也没有专门学过这方面的知识,下面的介绍也是经验之谈. 这里 我用的 K9F2G08-SCB0 这款nand flas

那种方法计算多空逆转更正确呢?——从此图1看应该是TEST005,但是实际上是ZCL_多空! TEST005具有滞后性!也就是说跌了一些在报警,可能已经跌了10%(如图2) ZCL_多空:当计算结果和TEST005相同时(没有跳空时), 可能也会事后报警,不过此类报警往往滞后性不强. 但当计算结果不同时,往往会提前预警,此时结合短线T+0操作,往往能卖在最高点!