关于RNA-Seq数据去接头(Adapter)这事需要讲一讲 RNA-Seq adapter barcode cutadapt 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已知的核酸链,用于链接序列未知的目标测序片段. 2.barcode,也称为index,是一段很短的寡居核酸链,用于在多个样品混合测序时,标记不同的样品. 3.insert是用于测序的目标片段,因为是包括在两个adapter之间,所以被称为“插入”片段. 首先来了解一下三个概念: 1.adapter是一段短的序列已

本节课程,需要完成扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们拿到了双端数据,进行了质控.并对实验设计进行了填写和检查.最后将双端数据合并为单个文件进行下游分析.   接下来我们将序列末端的barcode标签切下来,因为它们是人为添加的,不属于实验对象:再根据标签序列与实验设计文件比对,对每条序列属于哪个样品进行分类:最后我们切除掉扩增使用的引物,因为它们是人工合成的

今天偶然的机会,客户打电话说有一台DELL T110的服务器换了主板电池RAID信息没了进不去系统了,问我怎么处理,T110的RAID是主板集成的S100的RAID卡(算是软RAID,通过BIOS配置RAID,所有计算都是由主板CPU提供),我的第一想法是从新配置RAID,但是想到配置的过程需要初始化磁盘,意味着所有数据会丢失,方法不可行,导入RAID信息也不行,因为这个RAID卡比较低级不支持,这时候客户说我拿两块新盘放到机器上从新配置下RAID(级别不变),配置完成后再放回以前的硬盘看是否好

项目内容: 在智联招聘上爬取杭州市互联网公司的位置信息,属于哪个区: 如果公司信息内不含区信息,则通过百度地图接口获取所属区信息 scrapy+pycharm

Cell Ranger是一个"傻瓜"软件,你只需提供原始的fastq文件,它就会返回feature-barcode表达矩阵.为啥不说是gene-cell,举个例子,cell hashing数据得到的矩阵还有tag行,而列也不能肯定就是一个cell,可能考虑到这个才不叫gene-cell矩阵吧~它是10xgenomics提供的官方比对定量软件,有四个子命令,我只用过cellranger count,另外三个cellranger mkfastq.cellranger aggr.cellra

一.前言 上一篇博客我们通过命令行来操作Zookeper的客户端和服务端并进行相应的操作,这篇主要介绍如何通过API(JAVA)来操作Zookeeper. 二.开发环境配置 首先打开Zookeeper服务端(上一篇博客有具体的方法),方便客户端连接. 配置开发环境环境可以有两种方式:① 直接下载相关的依赖Jar包,然后在IDE中添加依赖 ② 建立maven项目,使用maven进行依赖管理. ① 手动添加依赖至IDE 步骤一:点击这里下载对应版本的Jar包,包括(jar.javadoc.jar.s

图片中存在着色版的概念,二维矩阵的每个元素的值指定了一种颜色,因此可以显示出彩色. 迁移调色板 下述python代码将VOC数据集中的某个语义分割的图片的调色板直接应用在一个二维矩阵代表的图像上 #label_im is a numpy array of 1 x height x width #return an Image object,call its' save('out.png') functioin to save as image file def palette( label_im

2008-11   Satoshi Nakamoto  Bitcoin: A Peer-to-Peer Electronic Cash System http://p2pbucks.com/?p=9963 https://bitcoin.org/bitcoin.pdf http://www.useit.com.cn/thread-11046-1-1.html 比特币白皮书,一种点对点的电子现金系统 1. 比特币白皮书简介 互联网上的贸易,几乎都需要借助金融机构作为可资信赖的第三方来处理电子支付信

·find   path   -option   [   -print ]   [ -exec   -ok   command ]   {} \; find命令的参数: pathname: find命令所查找的目录路径.例如用.来表示当前目录,用/来表示系统根目录.-print: find命令将匹配的文件输出到标准输出.-exec: find命令对匹配的文件执行该参数所给出的shell命令.相应命令的形式为'command' { } \;,注意{ }和\:之间的空格.-ok: 和-exec的作用

php是嵌入式脚本语言(意义也就不言而喻) 标识:<?php ....  ?>         输出:echo "**"; 使用美元符号($)后跟变量名表示变量,区分大小写:由英文字母或下划线开头,后面跟任意数量的英文字母,数字,下划线 变量类型:整数,浮点,字符串,布尔,数组,对象 在使用("**")输出字符串时,含有$符号,应该使用转义字符"\",来制定特殊的字符.单引号('**')不需要 在php中使用点(.)来连接两个字符串.

前面讲解了平衡查找树中的2-3树以及其实现红黑树.2-3树种,一个节点最多有2个key,而红黑树则使用染色的方式来标识这两个key. 维基百科对B树的定义为“在计算机科学中,B树(B-tree)是一种树状数据结构,它能够存储数据.对其进行排序并允许以O(log n)的时间复杂度运行进行查找.顺序读取.插入和删除的数据结构.B树,概括来说是一个节点可以拥有多于2个子节点的二叉查找树.与自平衡二叉查找树不同,B-树为系统最优化大块数据的读和写操作.B-tree算法减少定位记录时所经历的中间过程,从而

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本节又带了一些常用的,却很难理解的问题,本节从文件上传功能的实现引出了线程使用,介绍了线程饥饿的解决方法,异常处理方法,了解RouteTable自定义路径 . 系列文章 七天学会ASP.NET MVC (一)——深入理解ASP.NET MVC 七天学会ASP.NET MVC (二)——ASP.NET MVC 数据传递 七天学会ASP.NET MVC (三)——ASP.Net MVC 数据处理 七天学会ASP.NET MVC (四)——用户授权认证问题 七天学会ASP.NET MVC (五)——L

查找是在大量的信息中寻找一个特定的信息元素,在计算机应用中,查找是常用的基本运算,例如编译程序中符号表的查找.本文简单概括性的介绍了常见的七种查找算法,说是七种,其实二分查找.插值查找以及斐波那契查找都可以归为一类——插值查找.插值查找和斐波那契查找是在二分查找的基础上的优化查找算法.树表查找和哈希查找会在后续的博文中进行详细介绍. 查找定义:根据给定的某个值,在查找表中确定一个其关键字等于给定值的数据元素(或记录). 查找算法分类: 1)静态查找和动态查找: 注:静态或者动态都是针对查找表而言

写在前面: 以前真心没有玩过Linux系统,总感觉整天摆弄Linux的同学都是大牛.如今,在公司里实习需要远程登录Linux服务器,所有的代码都要在开发板上完成,所以被逼无奈也不得不定下心来好好学学Linux系统的各种操作.我现在用的远程登录软件是PuTTY,所以简单总结一下常用的PuTTY指令,方便以后进行查阅. 1. PuTTY介绍 随着Linux在服务器端应用的普及,Linux系统管理越来越依赖于远程.在各种远程登录工具中,PuTTY是出色的工具之一.PuTTY是一个免费的.Windows

Linux中find常见用法示例 ·find   path   -option   [   -print ]   [ -exec   -ok   command ]   {} \; find命令的参数: pathname: find命令所查找的目录路径.例如用.来表示当前目录,用/来表示系统根目录.-print: find命令将匹配的文件输出到标准输出.-exec: find命令对匹配的文件执行该参数所给出的shell命令.相应命令的形式为'command' { } \;,注意{ }和\:之间的

转自:http://blog.csdn.net/yangzhiloveyou/article/details/8832516 output_example.c 中AV同步的代码如下(我的代码有些修改),这个实现相当简单,不过挺说明问题. 音视频同步方法:选择一个参考时钟,参考时钟上的时间是线性递增的,生成数据流时依据参考时钟上的时间给每个数据块 都打上时间戳(一般包括开始时间和结束时间).在播放时,读取数据块上的时间戳,同时参考当前参考时钟上的时间来安 排播放.数据流不会发生参考关系. 步骤:1

通常,编程工具IDE都提供了相应的调试模块,供开发者使用,以便更快速的定位问题所在.那么在JMeter编写测试脚本的过程中,JMeter都提供了哪些调试工具供我们使用呢? JMeter常用的调试工具有如下五种: 1.View Tree:查看结果树.含请求信息.响应信息等,请求头信息中的cookie信息一般默认不会显示,可通过修改JMeter配置参数进行显示.日常大家用的挺多的,在此不再赘述. 2.HTTP Mirror Server:HTTP镜像服务器.用于查看请求信息. 3.Debug Pre

前言 本文摘自Google JavaScript编码规范指南,截取了其中比较容易理解与遵循的点作为团队的JavaScript编码规范. JavaScript 语言规范 变量 声明变量必须加上 var 关键字.     当你没有写 var, 变量就会暴露在全局上下文中, 这样很可能会和现有变量冲突. 另外, 如果没有加上, 很难明确该变量的作用域是什么, 变量也很可能像在局部作用域中, 很轻易地泄漏到 Document 或者 Window 中, 所以务必用 var 去声明变量. 常量     常量

数据库优化的目标无非是避免磁盘I/O瓶颈.减少CPU利用率和减少资源竞争.为了便于读者阅读和理解,笔者参阅了Sybase.Informix和Oracle等大型数据库系统参考资料,基于多年的工程实践经验,从基本表设计.扩展设计和数据库表对象放置等角度进行讨论,着重讨论了如何避免磁盘I/O瓶颈和减少资源竞争,相信读者会一目了然. 基于第三范式的基本表设计 在基于表驱动的信息管理系统(MIS)中,基本表的设计规范是第三范式(3NF).第三范式的基本特征是非主键属性只依赖于主键属性.基于第三范式的数据库

Linux中find常见用法示例 ·find   path   -option   [   -print ]   [ -exec   -ok   command ]   {} \; find命令的参数: pathname: find命令所查找的目录路径.例如用.来表示当前目录,用/来表示系统根目录.-print: find命令将匹配的文件输出到标准输出.-exec: find命令对匹配的文件执行该参数所给出的shell命令.相应命令的形式为'command' { } \;,注意{ }和\:之间的