prefetch 用ASCP下载

2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera从NCBI的SRA数据库中下载原始测序数据

目录 1.Conda连接不上镜像源问题 2. aspera不能再独立使用 3.使用prefetch搭配aspera 4. prefetch下载方法 记录下下载过程,为自己和后人避坑. 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题.即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错. CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://mirrors.tuna.tsi 尝试了很多方法:换源,删除.co

NCBI下载sra数据（新）

  今天要上NCBI下载sra数据发现没有下载的链接,网上查发现都是老的方法,NCBI页面已经变更,于是看了NCBI的help,并且记录下来新版的sra数据下载方法,要用NCBI的工具SRA Toolkit.另外咨询师兄,总结得到新的wget下载的方法. 方法1 NCBI告知的方法(中断不能继续下载) 下载SRA Tookit https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software:点击software,选择需要的sra t

&amp;lt;二代測序&amp;gt; 下载 NCBI sra 文件

本文近期更新地址: http://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/51077222 随着測序技术的不断提高.二代測序数据成指数增长. NCBI提供了SRA数据库存储这些数据. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra 为了方便更好的分析这些数据,NCBI提供了下载的命令行工具:sra-toolkit. 包含下面命令: 官方文档: http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi

preload 与 prefetch 的区别

Preload 浏览器会在遇到如下link标签时,立刻开始下载main.js(不阻塞parser),并放在内存中,但不会执行其中的JS语句. 只有当遇到script标签加载的也是main.js的时候,浏览器才会直接将预先加载的JS执行掉. <link rel="preload" href="/main.js" as="script"> Prefetch 浏览器会在空闲的时候,下载main.js, 并缓存到disk.当有页面使用的时候,

preload、prefetch的认识

预加载 现在的网络情况虽然很乐观,但是 defer和async 当浏览器碰到 script 脚本的时候: <script src="script.js"></script> 没有 defer 或 async,浏览器会立即加载并执行指定的脚本,"立即"指的是在渲染该 script 标签之下的文档元素之前,也就是说不等待后续载入的文档元素,读到就加载并执行. <script async src="script.js"&g

带你玩转prefetch, preload, dns-prefetch，defer和async

现代浏览器性能优化-JS篇 众所周知,JS的加载和执行会阻塞浏览器渲染,所以目前业界普遍推荐把script放到</body>之前,以解决js执行时找不到dom等问题.但随着现代浏览器的普及,浏览器为我们提供了更多强大的武器,合理利用,方可大幅提高页面加载速度. 理解渲染过程(HTML Parser) 首先我们从浏览器的角度解释一下从输入URL到页面展示经历了些什么,以如下html文档举例 <html> <head> <link rel="styleshe

7、sraToolkit安装使用

参考:http://blog.csdn.net/Cs_mary/article/details/78378552        ###prefetch 参数解释 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK158900/#SRA_download.how_do_i_use_the_sra_toolki    ##  convert data into a particular format (fastq-dump等) https://github.com/ncbi

8、SRR数据下载https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.8.2/

1.prefetch SRRxxxxxx         -/ncbi/public/sra 2.fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3.SRA.SAM以及Fastq文件高速下载方法 3.1 NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI (National Center for Biotechnology Information),它是一个保存高通量测序原始数据以及比对信息和元数据 (metad

通读SDWebImage①--总体梳理、下载和缓存

本文目录 下载操作SDWebImageDownloaderOptions和下载过程实现 下载管理SDWebImageDownloader 缓存SDImageCache SDWebImageManager:按需下载->完成缓存->缓存管理等一系列完整的流程线 要写点关于SDWebImage的文章了,这段时间看的不少,总体的感受是SDWebImage的代码不如AFN那么规整.有条理,并没有吐槽的意思,稍微细细看一下就会有这样的感受.本篇文章不会用大量的篇幅来介绍SDWebImage如何使用,而是更

HTML a标签、4个伪类、常用属性(下载)、锚链接（待扩展：邮件、电话、短信、GPS）

HTML 超链接<a> 1.超链接可以是一个字.一个词.一组词.一幅图像,您可以点击这些内容来跳转到新的文档或者当前文档中的某个部分. 2.当您把鼠标指针移动到网页中的某个链接上时,箭头会变为一只小手. 3.标签<a> 中使用了href属性来描述链接的地址. 默认情况下,链接将以以下形式出现在浏览器中: 一个未访问过的链接显示为蓝色字体并带有下划线. 访问过的链接显示为紫色并带有下划线. 点击链接时,链接显示为红色并带有下划线. 注意:如果为这些超链接设置了 CSS 样式,展示样式

下载SRA文件

sratoolkit.2.6.2-centos_linux64/bin/prefetch  下载SRA文件 fastq-dump    --split-3    SRR2923014.sra    转成fq文件

详解HTML5中rel属性的prefetch预加载功能使用

在HTML5中,有个很有用但常被忽略的特性,就是预先加载(prefetch),它的原理是: 利用浏览器的空闲时间去先下载用户指定需要的内容,然后缓存起来,这样用户下次加载时,就直接从缓存中取出来,效率就快了. 举个例子说明:比如要预先加载某个页面,可以这样: XML/HTML Code <link rel="prefetch" href="http://www.example.com/"> <!-- Firefox --> 但如果是googl

NCBI原始数据下载by Aspera Connect

主要参考这篇文章: http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NjU5NjQ4MA==&mid=2651154488&idx=1&sn=e693a1a1f8163960e99812a6d7473aa0&scene=23&srcid=0831PboACKYo6omCEfKhXLhV#rd 因为昨天刚装了centOS,所以这里只贴出linux下的操作: 1. 进入linux服务器,下载aspera. 输入:wgethttp://downlo

HTML5的页面资源预加载技术(Link prefetch)加速页面加载

不管是浏览器的开发者还是普通web应用的开发者,他们都在做一个共同的努力:让Web浏览有更快的速度感觉.有很多已知的技术都可以让你的网站速度变得更快:使用CSS sprites,使用图片优化工具,使用.htaccess设置页面头信息和缓存时间,JavaScript压缩,使用CDN等.我曾经介绍过本站上使用的一些速度优化技术.而在HTML5里,出现了一个新的用来优化网站速度的新功能:页面资源预加载/预读取(Link prefetch). 页面资源预加载/预读取(Link prefetch)是什么?

页面资源预加载(Link prefetch)功能加速你的页面加载速度

有了浏览器缓存,为何还需要预加载? 用户可能是第一次访问网站,此时还无缓存 用户可能清空了缓存 缓存可能已经过期,资源将重新加载 用户访问的缓存文件可能不是最新的,需要重新加载 页面资源预加载/预读取(Link prefetch)是什么? 页面资源预加载(Link prefetch)是浏览器提供的一个技巧,目的是让浏览器在空闲时间下载或预读取一些文档资源,用户在将来将会访问这些资源.一个Web页面可以对浏览器设置一系列的预加载指示,当浏览器加载完当前页面后,它会在后台静悄悄的加载指定的文档,并把

使用HTML5的页面资源预加载(Link prefetch)功能加速你的页面加载速度

不管是浏览器的开发者还是普通web应用的开发者,他们都在做一个共同的努力:让Web浏览有更快的速度感觉.有很多已知的技术都可以让你的网站速度变得更快:使用CSS sprites,使用图片优化工具,使用.htaccess设置页面头信息和缓存时间,JavaScript压缩,使用CDN等.我曾经介绍过本站上使用的一些速度优化技术.而在HTML5里,出现了一个新的用来优化网站速度的新功能:页面资源预加载/预读取(Link prefetch). 页面资源预加载/预读取(Link prefetch)是什么?

Preload，Prefetch 和它们在 Chrome 之中的优先级

前言 上周五到的时候,想起之前在手游平台上有处理dns-prefetch的优化,那这篇分享的就更仔细了.今日早读文章由@gy134340翻译并授权分享. 正文从这开始- 今天我们来深入研究一下 Chrome 的网络协议栈,来更清晰的描述早期网络加载(像 <link rel="preload" 和 <link rel="prefetch">)背后的工作原理,让你对其更加了解. 像其他文章描述的那样,preload 是声明式的 fetch,可以强制浏览

Web 性能优化：Preload与Prefetch的使用及在 Chrome 中的优先级

摘要: 理解Preload与Prefetch. 原文:Web 性能优化:Preload,Prefetch的使用及在 Chrome 中的优先级 作者:前端小智 Fundebug经授权转载,版权归原作者所有. 这是 Web 性能优化的第 6 篇,上一篇在下面看点击查看: Web 性能优化:使用 Webpack 分离数据的正确方法 Web 性能优化:图片优化让网站大小减少 62% Web 性能优化:缓存 React 事件来提高性能 Web 性能优化:21种优化CSS和加快网站速度的方法 Web 性能优

DNS预解析prefetch

前面的话 本文将详细介绍DNS预解析prefetch的主要内容 概述 DNS(Domain Name System, 域名系统),是域名和IP地址相互映射的一个分布式数据库.DNS 查询就是将域名转换成 IP 的过程,这个过程短的话 2ms 几乎无感,长则可能达到几秒钟 当浏览器访问一个域名的时候,需要解析一次DNS,获得对应域名的ip地址.在解析过程中,按照浏览器缓存.系统缓存.路由器缓存.ISP(运营商)DNS缓存.根域名服务器.顶级域名服务器.主域名服务器的顺序,逐步读取缓存,直到拿到IP

资源预加载preload和资源预读取prefetch简明学习

前面的话 基于VUE的前端小站改造成SSR服务器端渲染后,HTML文档会自动使用preload和prefetch来预加载所需资源,本文将详细介绍preload和prefetch的使用 资源优先级 在介绍preload和prefetch之前,首先要介绍浏览器的资源优先级 在Chrome浏览器中,不同的资源在浏览器渲染的不同阶段进行加载的优先级不同 一共分成五个级别 Highest 最高 Hight 高 Medium 中等 Low 低 Lowest 最低 其中主资源HTML和CSS的优先级最高,其他

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