[怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM 文件,得到map.sorted.bam system"samtools sort map.b/am map.sorted"; #第三步:创建一个关于bam的索引文件,我们得到一个map.sorted.b

微信Web开发者工具只有window版本和mac版本,如果想要在Linux系统下运行微信Web开发者工具,需要花费很大周折. 注:带 * 的步骤或文件为不确定是否管用的步骤或文件.本人系统为Linux Mint 18.1版本. 1.下载nwjs 下载nwjs的SDK. 2.将微信web开发者工具拷贝到nwjs 将在window系统下安装的微信web开发者工具文件夹中的package.nw.icon.ico.* 微信web开发者工具.exe拷贝到nwjs sdk解压后的文件夹内. * 解压 微信w

第六节 Linux系统基础优化 标签(空格分隔):Linux实战教学笔记-陈思齐 第1章 基础环境 第2章 使用网易163镜像做yum源 默认国外的yum源速度很慢,所以换成国内的. 第一步:先备份 mkdir backup mv C* backup/ 第二步:下载163yum源 wget http://mirrors.163.com/.help/CentOS6-Base-163.repo 第三步:清除旧缓存 yum clean all 第四步:创建新缓存 yum makecache 第五步:安

在linux系统中你使用一些命令时(例如nmon.iostat 如下截图所示),有可能会看到一些名字为dm-xx的设备,那么这些设备到底是什么设备呢,跟磁盘有什么关系呢?以前不了解的时候,我也很纳闷. 其实dm是Device Mapper的缩写,Device Mapper 是 Linux 2.6 内核中提供的一种从逻辑设备到物理设备的映射框架机制,在该机制下,用户可以很方便的根据自己的需要制定实现存储资源的管理策略,当前比较流行的 Linux 下的逻辑卷管理器如 LVM2(Linux Volum

Linus 说“Just for fun”,而我要说“Just for 折腾”.想知道我是怎样折腾 Linux 的,请看下面这个截图: 从这个截图可以看出,我为了“折腾” Linux 系统,在我的电脑上安装的 5 个不同的发行版.它们分别是 Ubuntu 14.04 桌面版.CentOS 5.10.CentOS 6.5.Fedora 20 和一个 Ubuntu 14.04 Server 版.在以上所有系统中,只有 Ubuntu 14.04 桌面版和 Fedora 20 开启了 GUI,其它的几个

发博客时,总免不了要用图片说话.经过长时间的磨合,在 Linux 桌面系统下有几款图片处理软件我已经用得比较顺手了.这几款软件在 Linux 世界使用广泛,各个 Linux 发行版的软件仓库中都有自带的安装包,而且这几款软件运行稳定.界面美观.特在这里推荐给大家. 请看我的桌面,左边的 Luancher 中下面的五个图标就是我今天要介绍的五款图片处理工具: 一.截图工具 gnome-screenshot 这个软件不用自己安装,它是 Gnome 桌面自带的截图软件,一般在 Linux 系统安装完成

引言 之所以想到写这些东西,那是因为我确实想让大家也和我一样,把 Linux 桌面系统打造成真真正正日常使用的工具,而不是安装之后试用几把再删掉.我是真的在日常生活和工作中都使用 Linux,比如在 Linux 下编程.写博客.写论文和做幻灯.当然,对于 LibreOffice 这样的软件使用起来都不会有什么困难,所以在我的博客中就基本没有提到,就像 Windows 下的程序员不会去写 MS Office 的使用指南一样.如果有人不能坚持使用 Linux,那一定是 Linux 中的某些困难打败了

在linux系统中安装VSCode(Visual Studio Code) 1.从官网下载压缩包(话说下载下来解压就直接可以运行了咧,都不需要make) 访问Visual Studio Code官网 https://code.visualstudio.com/docs?dv=linux64 我是64位的: wget https://az764295.vo.msecnd.net/stable/7ba55c5860b152d999dda59393ca3ebeb1b5c85f/code-stable-

传统印象下Linux是非常坚不可摧的,具有千年不更新,万年不重启的美名.而随着虚拟化的推进,很多跑在虚拟化上的Linux由于先前基础架构的脆弱,变得适应性“越来越不好”,体现在IP存储如果出现节点故障而且没有冗余线路的保障很容易出现磁盘脱机导致的系统只读,加上LVM固有的习惯使用还会影响到系统在硬盘离线后数据恢复的困难,再者EXT系列的文件系统没有Windows 2008之后所使用的NTFS文件系统的自我修复功能,很多时候会让工作陷入各种深坑不能自拔. 笔者最近遇到一个奇葩的现象,某平台因为IP

今天在开发中遇到这么个问题,将连接的数据库改为服务器上的时候(服务器是Linux系统的),程序跑起来后一直出错,总提示数据库的表找不到, 而打开数据库看该表明明是存在的,在我的印象中MySQL数据是不区分大小写的,后来查资料才发现,在Linux系统中MySQL默认是严格区分大小 写的,可以在配置文件中添加配置, 用root帐号登录后,在/etc/my.cnf 中的[mysqld]后添加添加lower_case_table_names=1,重启MYSQL服务,这时已设置成功:不区分表名的大小写:

一台安装了Linux系统的电脑如果想要联网,首先要做的就是进行网络配置.今天小编就以CentOS6.4系统为例为大家介绍整个网络配置的过程,虽然只是以CentOS6.4系统为例,但是其它的Linux系统在流程上也相差不大.相信只要大家能够按照小编的经验熟练掌握配置过程,其它Linux系统的网络配置一定也能够很好的完成. 首先以根用户登录系统,然后使用lspci | grep Ethernet命令检查计算机上的以太网卡设备是否被内核检测到.这里小编要提醒大家,在默认的情况下,只有root也就是根用

在实际工作中有时需要程序打印出某个进程的内存占用情况以作参考, 下面介绍一种通过Linux下的伪文件系统/proc 计算某进程内存占用的程序实现方法. 首先, 为什么会有所谓的 伪文件 呢. Linux系统的文件类型大致可分为三类: 普通文件, 目录文件和伪文件. 伪文件不是用来存储数据的, 因此这些文件不占用磁盘空间, 只是存在于内存中. /proc 让你可以与内核内部数据进行交互, 获取有关进程的有用信息. 下面主要介绍一下 /proc 下面的四个文件: /proc/stat, /proc/

Linux系统可以通过top命令查看系统的CPU.内存.运行时间.交换分区.执行的线程等信息.通过top命令可以有效的发现系统的缺陷出在哪里.是内存不够.CPU处理能力不够.IO读写过高. 使用SSHClient客户端连接到远程Linux系统.使用top命令查看系统的当前运行的情况.如图对top命令执行的结果做了简单的图解,下面针对每一项做详细的解释.   top命令的第一行"top - 19:56:47 up 39 min,  3 users,  load average: 0.00, 0.0

前几天被版本管理困扰了好久,主要是因为 没法回到之前的版本,新版本又出了问题真的很尴尬. 终于决定使用目前网上很火的版本管理工具-------Git 历史啥的就不说了,说些有用的. 我用的是oschina的至于为啥没用github是因为如果想要使用私有项目 github是收费的.好在用法是一样的,开始吧! 首先说明我是linux系统(国产系统deepin , 如果你使用Ubuntu这个教程也适用你哦!) 安装git很简单: sudo install git 输入用户名密码 一路安装很简单不多说.

文件描述符 进程每打开一个文件的时候,会获得该文件的文件描述符,而后续的读写操作都把文件描述符作为参数.在用户空间或者内核空间,都是通过文件描述符来唯一地索引一个打开的文件.文件描述符使用int类型表示,文件描述符的范围从0开始,到上限值-1,默认情况下,上限值为1024,也就是说,进程默认情况下最多可以打开1024个文件.负数是不合法的文件描述符,当函数调用出错时,返回的文件描述符为-1. 每个进程都至少包含三个文件描述符: 文件描述符 表示 宏 0 标准输入(stdin) STDIN_FIL

一.环境变量文件介绍 转自:http://blog.csdn.net/cscmaker/article/details/7261921 Linux中环境变量包括系统级和用户级,系统级的环境变量是每个登录到系统的用户都要读取的系统变量,而用户级的环境变量则是该用户使用系统时加载的环境变量. 所以管理环境变量的文件也分为系统级和用户级的,下面贴一个网上找到的讲的比较明白的文件介绍(略作修改)[1]: 1.系统级: (1)/etc/profile:该文件是用户登录时,操作系统定制用户环境时使用的第一个

1.链接的概念 在Linux系统中链接分为硬链接和软连接两种,一种为硬链接,另一种为软连接或符号链接(symbolic Link).ln命令就是创建链接文件的,在默认不带参数的情况下,执行ln命令创建的链接就是硬链接. 2.硬链接 硬链接是指通过索引节点(inode)来进行链接.在Linux(ext2,ext3)文件系统中,保存在磁盘分区中的文件不管是什么类型都会给它分配一个编号,这个编号被称为索引节点(inode).如果多个文件名指向同一个inode是正常且允许的.这种情况的文件就称为硬链接.

Linux系统每次重新启动时,不会重新打开无线网卡,需要每次手动去更改. 这里通过两种方式开启无线网卡. 第一种方式就是手动连接到Linux系统,(前提是按照了Linux桌面) 1.找到文件夹为 etc. 2.找到etc文件夹下面的sysconfig文件夹 3.找到sysconfig文件夹下面的network-scripts文件夹 4.打开文件为ifcfg-eth 修改ONBOOT=yes. 第二种方法,没有安装Linux系统桌面,可以通过客户端软件远程连接Linux修改配置. 1.linux系

Brief: 1./home单独分区:2.不同系统/home建立不同的用户名:3.不同系统/home对其他用户授权 Linux下/home文件夹可以通用吗?例如我机器上同时装了两个Linux系统,可以共用一个/home文件夹吗?又或者我重装Linux系统,原来的/home文件夹还可以使用吗? 问题一. /home共用的问题: 一般来说是可以这么做的.只是你要自己明白/home目录中的哪些更改分别对应哪个系统:再有就是有些个性化配置在不同系统中是否都支持.有个简单办法可以避免混乱,这就是创建不同用

linux系统加快大文件的写入速度 setvbuf进行优化内存IO

linux系统CentOS7 到http://mirrors.sohu.com/mysql/下载想要的mysql版本 这里用到的是 mysql-5.6.33-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz 用 WinSCP上传到指定的目录下,这里是 /usr/local/src 也可以直接在shell端提要供下载文件的详细url用wget命令下载到指定文件夹内 wget是一个从网络上自动下载文件的自由工具,它支持HTTP.HTTPS和FTP协议. -c : 接着下载没下载完的文件,允许