0. 基本参数 基因组大小:G Read读长:L 总Read条数:n_r 1. 碱基深度分布 单条Read测序覆盖到某一个碱基的概率:L/G 因为L/G很小,n_r很大,每个碱基覆盖深度服从泊松分布. 则每个碱基的覆盖深度的期望为:d_n=(L/G)*n_r 2. K-mer深度分布 假设基因组对K是unique的,可以得到G个不同的K-mer. 单条Read测序覆盖某个K-mer的概率:(L-K+1)/G 同样因为(L-K+1)/G很小,n_r很大,每个K-mer的覆盖深度服从泊松分布. 则每

JST空间分析工具包是一套JAVA API,提供一系列的空间数据分析操作.最近开发项目刚好需要用到,上网搜资料也少,就自己写下来记录一下.C++版本的拓扑分析开源工具叫:geos:.NET版本的拓扑分析开源工具叫:NTS. 1.下载 工具包下载地址:点击打开链接 2.学习资料 工具包里的官方入门文档:doc文件夹里的JTS Developer Guide.pdf.下载地址 官方API:jts-1.14\doc\javadoc\index.html 3.示例 (开发之前先引入lib文件夹内的所有J

一.好处 你是否已经对每次从Map中取得关键字然后再取得相应的值感觉厌倦? Set keys = map.keySet( ); if(keys != null) { Iterator iterator = keys.iterator( ); while(iterator.hasNext( )) { Object key = iterator.next( ); Object value = map.get(key); } } 二.用法 使用Map.Entry类,你可以得到在同一时间得到所有的信息.

原创文章,转载请注明出处,谢谢. Android应用程序分析主要有静态分析和动态分析两种,常见的静态分析工具是Apktool.dex2jar以及jdgui.今天突然主要到Google code上有个叫做androguard的工具,提供了一系列的Apk以及dex.odex.arsc等文件的分析处理功能.很值得学习和分析. androguard项目主页:http://code.google.com/p/androguard/ androguard是基于python的,将Apk文件中的dex文件,类,

在日K线图中一般白线.黄线.紫线.绿线依次分别表示:5.10.20.60日移动平均线,但这并不是固定的,会根据设置的不同而不同,比如你也可以在系统里把它们设为5.15.30.60均线. 你看K线图的上方有黄色PMA5=几的字样,就是五日均线等于几的意思.其他的有紫色的10日均线PMA10=什么的.设定的话双击数字就行!数字是几就是几日均线,颜色和线的颜色一样! 那是移动平均线,在日K线图中一般白线.黄线.紫线.绿线依次分别表示:5.10.20.60日移动平均线,但这并不是固定的,会根据设置的不同

问题来源:http://www.careercup.com/question?id=6335704 问题描述: Given a N*N Matrix. All rows are sorted, and all columns are sorted. Find the Kth Largest element of the matrix. 解答: 先给出算法的时空复杂度,时间O(k * lg k),空间O(k). 算法:为了方便描述不防假设矩阵左上角的元素最小,且k<=n. 1.  取每行行首元素建

题目大意:给定长度为n的数组,求出最大的区间和,其中区间长度在[1,k]之间 分析: 学动态规划的时候我们会遇到一个经典问题 最大子段和,这个题跟最大子段和很类似 不同的是区间的长度有限制,无法用原算法解决 转换思路 区间[i,j]的和就是ans=sum(j)-sum(i-1) ( j - i <=k) 那么对于每个j 我们肯定希望sum(i-1)最小,所以我们只需要对sum(i-1)维护一个单调队列,然后依次增加 j 同时将单调队列中不满足( j - i <k)的元素出队即可 代码: #in

  FProfiler  FProfiler是一个非常快的Java profiler.它利用BCEL和log4j来记录每个方法从开始到结尾的日记.FProfiler可以用来在你的应用程序,Servlet,Applet...中找出hotspots. 更多FProfiler信息   JRat  JRat是一个Java Runtime分析工具包.它的目的是让开发者更好的明白Java程序动行时的状态.JRat包括但并不只局限于性能剖析. 更多JRat信息   EJP  EJP(Extensible Ja

转自: http://www.cnblogs.com/BlackWalnut/p/4472122.html LL(K)语法分析技术是建立在预测分析的技术之上的.我们先来了解预测分析技术.考虑以下文法: 当使用该文法对(1*2-3)+4和(1*2-3)进行分析,前者因该调用E->E+T,而后者应该调用E->T,怎么确定到底使用哪个产生式呢?这就要使用预测分析技术来构建预测分析语法分析器,LL(k)是其一种.预测分析技术的关键是构建一个无冲突的预测分析表.所谓预测分析表就是程序可以根据当前的状态来

(转载请表明出处 http://www.cnblogs.com/BlackWalnut/p/4472122.html ) LL(K)语法分析技术是建立在预测分析的技术之上的.我们先来了解预测分析技术.考虑以下文法: 当使用该文法对(1*2-3)+4和(1*2-3)进行分析,前者因该调用E->E+T,而后者应该调用E->T,怎么确定到底使用哪个产生式呢?这就要使用预测分析技术来构建预测分析语法分析器,LL(k)是其一种.预测分析技术的关键是构建一个无冲突的预测分析表.所谓预测分析表就是程序可以根

<异动K线--庄家破绽(连载)> http://bbs.tianya.cn/post-stocks-612892-1.shtml ————马后炮分析,没有什么前瞻性.纯技术是害死许多钻牛角的股民． ————最后的总结很重要   给我一张K线图,我将知道庄家要干什么.这句话听起来似乎觉得有点狂妄,甚至觉得幼稚.毕竟对大多数投资者来说,股票的好坏由基本面决定,大势的好坏由经济环境决定.但在这里我们可以仔细想一下,所有的这些无论是基本面还是经济环境,在股市以什么方式表现出来呢?回答肯定是K线,因为无

A. Points on the line time limit per test 1 second memory limit per test 256 megabytes input standard input output standard output We've got no test cases. A big olympiad is coming up. But the problemsetters' number one priority should be adding anot

题目大意 求n!在k进制下的位数 2≤N≤2^31, 2≤K≤200 分析 作为数学没学好的傻嗨,我们先回顾一下log函数 \(\log_a(b)=\frac 1 {log_b(a)}\) \(\log_a (x^k)=k*\log_a x\) \(\log_a(bc)=log_a(b)+log_a(c)\) 嗯嗯,呵呵 我们要求的是\(log_k(n!)\) n大处理不了 用斯特林公式 \(n! \approx \sqrt{2\pi n} * (\frac n e)^n\) \(\log_k(

书中存在的一些疑问 kd树的实现过程中,为何选择的切分坐标轴要不断变换?公式如:x(l)=j(modk)+1.有什么好处呢?优点在哪?还有的实现是通过选取方差最大的维度作为划分坐标轴,有何区别? 第一种方法网上也没具体的解释,我不是很清楚其原因(可能要去论文上找原因). 不过第二种方法的话,方差越大,说明这个维度数据的相似性就越差,就越容易通过选取中点的方式将数据集分开,kd树的效率就越高,试想如果你挑了一个维度其中数据全为一样,那么kd树的建立过程就无法将使用挑选中位数的方法来达到,而且后面的

今天把自己用的win7渗透虚拟机和渗透工具脚本整合到一起备份传网盘了: D:\渗透工具包>dir 驱动器 D 中的卷是 DATA 卷的序列号是 0D74-084B D:\渗透工具包 的目录 // : <DIR> . // : <DIR> .. // : <DIR> arp嗅探 // : <DIR> src // : <DIR> webshell // : <DIR> XSS工具 // : <DIR> 代码审计 //

题意 : 设 NUM 是一个 n 位十进制整数.如果将 NUM 划分为 k 段,则可得到 k 个整数.这 k 个整数的乘积称为 NUM 的一个 k 乘积.试设计一个算法,对于给定的 NUM 和 k,求出 NUM 的最大 k 乘积 分析 : 定义 dp[i][j] = 前 i 个数字中间插入 j 个乘号时候的最大乘积是多少 初始化 dp[ i ][ 0 ] = NUM(1, i)  1 <= i <= len(NUM) 最后的结果则存于 dp[n][k] 状态转移方程为 dp[i][j] = m

0x00 背景 Httpd服务中的缓冲区溢出漏洞 复现参考文章https://www.4hou.com/posts/gQG9 Binwalk -Me 解压缩 File ./bin/busybox文件类型 MIPS 32位,小端 0x01 固件仿真环境搭建 在TPlink官网上直接找到了TP-Link TL-WR841N v14 2018-3月的固件版本,是漏洞修复前的,下载后想着既然没有实物,何不仿真运行呢? 在网上寻找资料过程中,在这篇文章[物联网设备固件模拟入门 ]中找到了相应工具,固件分析

题目描述 读入一个长度为n的整数数列a1,a2,…,an,以及一个整数K. q组询问. 每组询问包含一个二元组(l, r), 其中1≤l≤r≤ n, 求所有满足以下条件的二元组(l2, r2)的数目: 1: 1≤l≤l2≤r2≤r≤n, 2: 是k的倍数. 输入描述: 第一行一个整数T,表示有T组数据.对于每组数据, 第一行输入3个整数, n, q, k, 接下来一行输入n个整数,a1,a2,…,an, 接下来q行,每行输入2个整数 l, r 输出描述: 对于每一个询问,输出满足条件的二元组(l

Swift 开源项目精选-v1.0 2016-03-07 22:11 542人阅读 评论(0) 收藏 举报  分类: iOS(55)   Swift(4)    目录(?)[+]   转自 http://dev.swiftguide.cn/archive/featured-open-source-projects-in-swift_v1.0.html 目录 工具 存储 网络 图片 框架 界面 示例 应用 工具 SwiftyJSON By tangplin, lingoer : GitHub 上最

[bzoj1027]合金 分析 数形结合+计算几何+Floyd最小环. http://blog.csdn.net/popoqqq/article/details/40539273 虽然这样占大家的很不好,但是我的确需要这么做. 小结 (1)最小环的写法 (2)凸包的一种简易算法 RT. (3)关于计算几何的练习 通过做这道题,计算几何的模板也熟悉了一些. 计算几何如何调试? 这个么...好像只能瞪眼法了. 代码 #include <cstdio> #include <climits>

1.官网简介 http://cab.spbu.ru/software/quast-lg/ QUAST- lg是QUAST的一个扩展,用于评估大型基因组装配(直至哺乳动物大小).QUAST- lg从5.0.0版本开始包含在QUAST包中(下载最新版本).像往常一样运行QUAST,不要忘记在您的命令中添加‐large选项! 新功能的简短列表(参见所有更改): 通过使用新的快速比对(minimap2)和重构对齐分析模块,显著提高了速度 新的基于k-mer的评估基因组完整性和正确性度量 BUSCO增加了