激活qiime2的执行环境:source activate qiime2-2019.4如何查看conda已有的环境:conda info -e 以下分析流程参考:https://docs.qiime2.org/2019.4/tutorials/qiime2-for-experienced-microbiome-researchers/ 1.数据准备 现在我们常用的就是这种格式的数据,每个样品一对数据文件 数据来源:https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/

原网站:https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/75103929 声明:本文为QIIME2官方帮助文档的中文版,由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效,文档翻译己获QIIME2团队官方授权.由于QIIME2更新频繁,如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读最新版中文帮助. https://forum.qiime2.org/t/qiime2-1-chinese-manual/838 如中文翻译没有急时更新,新阅读英文原版 http

本示例的的数据来自文章<Moving pictures of the human microbiome>,Genome Biology 2011,取样来自两个人身体四个部位五个时间点   进入环境 source activate qiime2-2017.8 退出环境 source deactivate   准备数据 # 创建并进入工作目录 mkdir -p qiime2-moving-pictures-tutorialcd qiime2-moving-pictures-tutorial # 下

RxJS 博大精深,看了好几篇文章都没有明白. 范围牵扯到了函数响应式开发去了... 我对函数式一知半解, 响应式更是第一次听到... 唉...不过日子还是得过...混着过先呗 我目前所理解的很浅, 大致上是这样的概念. 1.某些场景下它比promise好用, 它善于过滤掉不关心的东西. 2.它是观察者模式 + 迭代器模式组成的 3.跟时间,事件, 变量有密切关系 4.世界上有一种东西叫 "流" stream, 一个流能表示了一段时间里,一样东西发生的变化. 比如有一个值, 它在某段时

1. 生成配置文件 第一次运行 conda config命令时,将会在用户的home目录创建该文件..condarc配置文件,是一种可选的(optional)运行期配置文件,其默认情况下是不存在的. (windows:C:\users\username\,linux:/home/username/) 2. 添加清华镜像和中科大镜像,文件内容如下: channels:   - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/   -

package 第九周作业1; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.IOException; import java.io.RandomAccessFile; import java.nio.channels.FileChannel; import java.util.Scanner; public class Main { public static void main(String[] arg

官方文档参考 (一)父组件 向 子组件 传值 ①在父组件中调用子组件处,绑定要传的数据data1, 如 <nav  :data1=" "  ></nav> ②此上子组件要接收来自父组件的数据data1,则要定义 props:{ data1:{ type:Object/Number/Boolean } } (二)子组件 向 父组件 传值 子组件中通过 事件触发 传递给父组件处理后的数据data2 1.何处理从父组件传来的props数据? 实例根据情况做相应数据处理

# 激活工作环境 source activate qiime2-2017.8 # 建立工作目录 mkdir -p qiime2-exporting-tutorial cd qiime2-exporting-tutorial 导出Feature/OTU表 wget -O feature-table.qza https://data.qiime2.org/2017.7/tutorials/exporting/feature-table.qza qiime tools export \ feature

# 激活工作环境 source activate qiime2-2017.8 # 建立工作目录 mkdir -p qiime2-importing-tutorial cd qiime2-importing-tutorial 导入带质量值的测序数据 地球微生物组标准混样单端数据 “EMP protocol” multiplexed single-end fastq 此类数据标准包括两个文件,扩展名均为fastq.gz,一个是barcode文件,一个是样品混样测序文件. # 建样品目录 mkdir

# 下载最新版QIIME 2 docker pull qiime2/core:2017.7 # 测试是否安装成功 docker run -t -i -v $(pwd):/mnt/hgfs/2017 qiime2/core:2017.7 qiime # 启动docker命令行,挂载目录至/mnt/hgfs/2017目录,退出自动移除 docker run --rm -v $(pwd):/mnt/hgfs/2017 --name=qiime -it qiime2/core:2017.7 这就相当于打

箱线图 箱形图(Box-plot)又称为盒须图.盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图.因形状如箱子而得名.在宏基因组领域,常用于展示样品组中各样品Alpha多样性的分布 第一种情况,最大或最小值没有超过1.5倍箱体范围 第二种情况,最大或最小值超过1.5倍箱体范围,外位延长线外,即异常值(outliers)   Alpha多样性 知识背景:Alpha多样性计算方法  常见的丰度估计方法有Shannon, Chao1和Observed OTU和PD whole tree等.我

再上一篇的开头说了创建对象的两种方式,一种是Object构造函数的方式,一种是对象字面量的方法.但这些方式创建多个对象的时候都会产生大量的重复代码.经过技术的进步也演化出来许多的创建对象的模式.本章会介绍 工厂模式,原型模式,构造函数模式和构造函数与原型模式的混合使用. 1,工厂模式 工厂模式是一个比较广为人知的模式,这种模式将细节抽象出来.代码如下 function createPerson(name,age,job){ var o =new Object(); o.name=name; o.