fai示例: Sc0000003 2774837 10024730 60 61 Sc0000004 2768176 12845826 60 61 Sc0000005 2756750 15660150 60 61 Sc0000006 2627294 18462857 60 61 Sc0000007 2472379 21133951 60 61 Sc0000008 2452568 23647548 60 61 NAME Name of this reference sequence LENGTH T

1. InputFormat接口 InputFormat接口包含了两个抽象方法:getSplits()和creatRecordReader().InputFormat决定了Hadoop如何对文件进行分片和接收, 它能够从一个 job 中得到一个 split 集合(InputSplit[]),然后再为这个 split 集合配上一个合适的 RecordReader(getRecordReader)来读取每个split中的数据.InputFormat接口的实现细节如下. public abstract

samtools faidx 能够对fasta 序列建立一个后缀为.fai 的文件,根据这个.fai 文件和原始的fastsa文件, 能够快速的提取任意区域的序列 用法: samtools faidx input.fa 该命令对输入的fasta序列有一定要求:对于每条序列,除了最后一行外, 其他行的长度必须相同, >one ATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGCAT GCATGCATGCATGCATGCATGCATGCATGC ATGCAT >two another chro

为了弄懂 patch中的 p0   p1    和.orig文件是啥,找到了这篇文章! 来源:http://www.cnblogs.com/super119/archive/2010/12/18/1909941.html diff和patch的使用.patch文件的格式解说   diff  diff是生成源码补丁的必备工具.其命令格式为:  diff [命令行选项] 原始文件 新文件 常用命令行选项如下:  -r 递归处理目录 -u 输出统一格式(unified format)  -N patc

在开发的过程中,通常会用到EditText,如何让虚拟键盘来适应输入框中内容的类型,通常我们都会在xml文件中加入android:inputType="". android:inputType="none"android:inputType="text"android:inputType="textCapCharacters"//前3个输入普通字符android:inputType="textCapWords&quo

用vim打开文件,vim -b file,选项-b是二进制模式打开   然后输入 :%!xxd,就可看到二进制编码     其实在linux下,直接输入xxd file 也是可以看到的文件二进制格式的

文件是 MapReduce 任务数据的初始存储地.正常情况下,输入文件一般是存储在 HDFS 里面.这些文件的格式可以是任意的:我们可以使用基于行的日志文件, 也可以使用二进制格式,多行输入记录或者其它一些格式.这些文件一般会很大,达到数十GB,甚至更大.那么 MapReduce 是如何读取这些数据的呢?下面我们来学习 InputFormat 接口 1.InputFormat接口 InputFormat接口决定了输入文件如何被 Hadoop分块(split up)与接受.InputFormat

1.引入头文件fstreamfstream头文件定义了用于文件输入的类ifstream和文件输出的类ofstream 2.写文件1)创建一个ofstream对象来管理输出流2)将该对象与文件关联起来3)使用cout方式使用该对象,唯一区别是输出将进入文件,而不是屏幕.4)关闭到文件的连接示例如下: ofstream fout; fout.open("test.txt"); fout<<"write something"; fout.close(); 创建

1)InputFormat的类图: InputFormat 直接子类有三个:DBInputFormat.DelegatingInputFormat和FileInputFormat,分别表示输入文件的来源为从数据库.用于多个输入以及基于文件的输入.对于FileInputFormat,即从文件输入的输入方式,又有五个继承子类:CombineFileInputFormat,KeyValueTextInput,NLineInoutFormat,SequenceFileInputFormat,TextIn

文件 一个文件通常就是磁盘上的一段命名的存储区.但对于操作系统来说,文件就会更复杂一些.例如,一个大文件可以存储在一些分散的区段中,或者还会包含一些使操作系统可以确定其文件类型的附加数据. C将文件看成是连续的字节序列,其中每一个字节都可以单独地读取.ANSI C提供了文件的两种视图:文本视图和二进制视图. 1° 文本视图和二进制视图 ANSI要求提供的两种文件视图是文本视图和二进制视图.在二进制视图中,文件中的每个字节都可以为程序所访问.在文本视图中,程序看到的内容和文件的内容有可能不同.举例

MXF素材文件交换格式深入研究   2012-09-03 | 访问次数:262 | 新闻来源:电科网               [摘要]DCI规定数字电影需采用MXF封装音视频等节目素材内容.为了深入理解MXF基础原理,本文研究了MXF素材文件交换格式,详细介绍了MXF文件的物理结构和逻辑结构,并介绍了MXF中如头部元数据.索引表.操作模式.字节对齐等重要概念.         [关键字]MXF分区索引表随机索引包头部元数据操作模式KAG       前言   根据DCI 规范,数字电影数据包

office版本:2016 系统版本:win10 问题描述: 1.桌面新建excel表格后,打开时,提示“Excel无法打开文件xxx.xlsx,因为文件格式或文件扩展名无效.请确定文件未损坏,并且文件扩展名与文件的格式匹配” 2.点击确认后,通过文件->新建->空白工作簿->另存为->xxx.xlsx,可正常打开 3.能打开之前保存的excel文件 截图:  出现原因: 安装极速PDF阅读器其他办公套件,后卸载,发现右键不能新建word/excel/ppt ,后采取http://

读取标准输入<STDIN> <STDIN>表示从标准输入中读取内容,如果没有,则等待输入.<STDIN>读取到的结果中,如果没有意外,都会自带换行符. 例如,test.plx文件内容: #!/usr/bin/perl # $line=<STDIN>; if($line eq "\n"){ print "blank line\n"; } else { print "not blank: $line"

输入格式 1.输入分片与记录  2.文件输入  3.文本输入  4.二进制输入  5.多文件输入  6.数据库格式输入 详细的介绍:https://blog.csdn.net/py_123456/article/details/79766573 1.输入分片与记录 1.JobClient通过指定的输入文件的格式来生成数据分片InputSplit.  2.一个分片不是数据本身,而是可分片数据的引用.  3.InputFormat接口负责生成分片. InputFormat 负责处理MR的输入部分,有

C语言: 一 打开关闭文件 1 fopen函数 用于打开文件 FILE *fopen(char *filename, *type); fopen("c:\\ccdos\\clib", "rb");  如果成功的打开一个文件, fopen()函数返回文件指针,否则返回空指针(NULL).由此可判断文件打开是否成功. "r" 打开文字文件只读 "w" 创建文字文件只写 "a" 增补,如果文件不存在则创建一个 &

此输入格式的作用就是可以将来自多个不同文件的物理块作为一个split,然后由一个map进行处理. http://www.blogjava.net/shenh062326/archive/2012/07/03/hadoop.html

MultipleInput输入格式允许一个job的输入为多个文件夹下的文件(也就是多路径输入),并且不同文件夹下的文件可以实现不同的map逻辑,不过貌似必须使用相同的reduce逻辑. http://blog.csdn.net/u010366796/article/details/44727471 http://my.oschina.net/sbzhouhao/blog/165495 http://www.cnblogs.com/zhangchaoyang/articles/2649660.ht

一.awk简介  1.awk是3个姓氏的首字母,代表该语言的3个作者,awk的版本有很多,包括:旧版awk,新版awk(nawk),GNU awk(gawk)等.    awk程序有awk命令,括在引号或写在文件中的指令以及输入文件这几个部分组成.    2.检查系统中是否安装有awk  [root@rhel helinbash]# which awk  /bin/awk  [root@rhel helinbash]# which gawk  /bin/gawk  [root@rhel heli

不多说,直接上代码. 代码 package zhouls.bigdata.myMapReduce.ScoreCount; import java.io.DataInput; import java.io.DataOutput; import java.io.IOException; import org.apache.hadoop.io.WritableComparable; /** * 学习成绩读写类 * 数据格式参考:19020090017 小讲 90 99 100 89 95 * @aut

推荐 MapReduce分析明星微博数据 http://git.oschina.net/ljc520313/codeexample/tree/master/bigdata/hadoop/mapreduce/05.%E6%98%8E%E6%98%9F%E5%BE%AE%E5%8D%9A%E6%95%B0%E6%8D%AE%E5%88%86%E6%9E%90?dir=1&filepath=bigdata%2Fhadoop%2Fmapreduce%2F05.%E6%98%8E%E6%98%9F%E5%