Finding Enriched Motifs in Genomic Regions (findMotifsGenome.pl) 在指定区域做motif enrichment,大大降低了假阳性. MEME也可以做,但是设定更加复杂. 转录因子的表达具有高度的组织特异性,而且已知的TF只有1000多个,基因有30000多个,所以一个TF的靶基因可能有几百个,而且具有高度的时空组织特异性. 实验的方法就不说了,可靠.成本高.耗费劳力. 以下只说高通量数据的预测方法. 最简单的预测就是基于基因表达,c

miRNA分析--数据过滤(一) miRNA分析--比对(二) 根据miRNA Target Prediction in Plants, miRNA并非所有区域都要求严格匹配,其中第1位碱基和第14位以后的碱基是允许错配(以miRNA 5'为始). miRNA 文件提交不管是U或者T都是可以的 miRNA 靶基因预测我采用了3个工具 1.psRNATarget: A plant Samll RNA Target Analysis Server 进去以后,提交自己miRNA文件,fasta格式,并

Linux 文件查找 在Linux系统的查找相关的命令: which 查看可执行文件的位置 whereis 查看文件的位置 locate 配合数据库查看文件位置 find 实际搜寻硬盘查询文件名称 whereis whereis命令是定位可执行文件.源代码文件.帮助文件在文件系统中的位置.这些文件的属性应属于原始代码,二进制文件,或是帮助文件.whereis 程序还具有搜索源代码.指定备用搜索路径和搜索不寻常项的能力. 语法 whereis [-bmsu] 文件或者目录名称 参数 -b 定位可执

一.查找文件 使用快捷键[ctrl+shift+R]弹出弹出文件查找框,如下图所示: 二.查找包含某个字符串的文件 使用快捷键[ctrl+H]在弹出对话框中选File Search选项,然后在第一个文本框中粘贴(我一般用粘贴)或自已手动录入(容易写错)要查找的字符串(可以是英文字符也可以是汉字),在第二个文本框中输入你所要查找的文件(比如:*.jsp)最后点击Search按钮,这样MyEclipse就会在整个当前的工作空间中查找所有的jsp文件,并把查找结果输出在控制台上,也可以多文件查找,只要

文件查找——搜索当前目录下的文件 知道大概的文件名称,使用 findf FileName findf.py import argparse, re, os from os.path import join parser = argparse.ArgumentParser() parser.add_argument('FILENAME', help='file name use regular expression') parser.add_argument('-e', metavar='EXCL

某个文件不知道放在哪里了,通常可以使用下面的一些命令来查找: which  查看可执行文件的位置 whereis 查看文件的位置 locate   配合数据库查看文件位置 find   实际搜寻硬盘查询文件名称 附:Linux文件查找命令find详解 which 命令详解 which命令的作用是,在PATH变量指定的路径中,搜索某个系统命令的位置,并且返回第一个搜索结果.也就是说,使用which命令,就可以看到某个系统命令是否存在,以及执行的到底是哪一个位置的命令. 1．命令格式: which 

文件查找流程图 从文件模块缓存中加载     尽管原生模块与文件模块的优先级不同,但是都不会优先于从文件模块的缓存中加载已经存在的模块. 从原生模块加载     原生模块的优先级仅次于文件模块缓存的优先级.require方法在解析文件名之后,优先检查模块是否在原生模块列表中.以http模块为例,尽管在目录下存在一个http/http.js/http.node/http.json文件,require(“http”)都不会从这些文件中加载,而是从原生模块中加载.     原生模块也有一个缓存区,同样

[root@localhost~]#序言 在今后的工作中,运维工程师每天的例行事务就是使用free -m,top,uptime,df -h...每天都要检查一下服务器,看看是否出现异常.那么今天我们就讲解一下关于运维工程师例行事务的知识!  开班第十一天: [root@localhost~]#今天的课程大纲 查看进程,中断进程,切换进程 内存与swap分区 linux中文件查找的基本方法 linux中是如何解压缩文件的 关于I/O重定向的知识点 远程scp配合管道 详细讲解: [root@loc

1.find文件查找指令 > find  目录  参数 参数值,参数 参数值.....    > find  /  -name  passwd   //从系统根目录开始递归查找name=passwd的文件    参数        -maxdepth  n  查找目录最深层次        -mindepth  n  查找目录最浅层次        -name  filename  根据文件名字查找        -size  大小    根据文件大小进行查找            大小单位5

在使用linux时,经常需要进行文件查找.其中查找的命令主要有find和grep.两个命令是有区的. 区别:(1)find命令是根据文件的属性进行查找,如文件名,文件大小,所有者,所属组,是否为空,访问时间,修改时间等. (2)grep是根据文件的内容进行查找,会对文件的每一行按照给定的模式(patter)进行匹配查找. 一.find命令 基本格式:find  path expression 1.按照文件名查找 (1)find / -name httpd.conf #在根目录下查找文件httpd

一.查找文件 使用快捷键[ctrl+shift+R]弹出弹出文件查找框,如下图所示: 二.查找包含某个字符串的文件 使用快捷键[ctrl+H]在弹出对话框中选File Search选项,然后在第一个文本框中粘贴(我一般用粘贴)或自已手动录入(容易写错)要查找的字符串(可以是英文字符也可以是汉字),在第二个文本框中输入你所要查找的文件(比如:*.jsp)最后点击Search按钮,这样MyEclipse就会在整个当前的工作空间中查找所有的jsp文件,并把查找结果输出在控制台上,也可以多文件查找,只要

原文地址:http://xinzong.blog.51cto.com/10018904/1749465 一.文件查找工具常用软件 locate: locate命令其实是find -name的另一种写法,但是要比后者快得多,原因在于它不搜索具体目录,而是搜索一个数据库/var/lib/locatedb,这个数据库中含有本地所有文件信息.Linux系统自动创建这个数据库,并且每天自动更新一次,所以使用locate命令查不到最新变动过的文件.为了避免这种情况,可以在使用locate之前,先使用upda

原博文出自于:http://www.cnblogs.com/xdp-gacl/p/3781749.html 感谢! 一.查找文件 使用快捷键[ctrl+shift+R]弹出弹出文件查找框,如下图所示: 二.查找包含某个字符串的文件 使用快捷键[ctrl+H]在弹出对话框中选File Search选项,然后在第一个文本框中粘贴(我一般用粘贴)或自已手动录入(容易写错)要查找的字符串(可以是英文字符也可以是汉字),在第二个文本框中输入你所要查找的文件(比如:*.jsp)最后点击Search按钮,这样

文件查找: 1.  which    查找可以执行文件,只搜索$PATH里的目录 $ which ls /bin/ls which只搜索$PATH里的目录,如果搜索当前目录的文件是没有任何结果的 $ ls -l 总用量 -rw-rw-r-- huanghao huanghao 3月 : a.txt $ which a.txt 2. whereis    与which差不多,只不过它会查找帮助文件,还会查找库文件 $ whereis ls .gz $ libip6tc.so: /lib/libip

VS 2005使用map文件查找程序崩溃原因 一般程序崩溃可以通过debug,找到程序在那一行代码崩溃了,最近编一个多线程的程序,都不知道在那发生错误,多线程并发,又不好单行调试,终于找到一个比较好的方法来找原因,通过生成map文件,由于2005取消map文件生成行号信息(vc6.0下是可以生成行号信息的,不知道microsoft怎么想的,在2005上取消了),只能定位在那个函数发生崩溃.这里可以通过生成cod文件,即机器码这一文件,具体定位在那一行崩溃. 首先配置vc2005生成map文件和c

find 命令eg: 一般文件查找方法: 1.  find /home -name file  ,  在/home目录下查找文件名为file的文件2.  find /home -name '*file*'  ,  在/home目录下查找文件名包含file的文件3.  find /home -name 'file*'  ,  在/home目录下查找以file开头的文件名的文件4.  find /home -size 512c  ,    在/home目录下查找512kb大小的文件5.  find

Linux文件查找查找主要包括:locate和find 1.locate 用法简单,根据数据库查找,非实时,用法: locate FILENAME 手动更新数据库(时间可能较长) updatedb 2.find 实时,精确,功能强大,用法: find 路径 查找标准 查找后动作 (1)路径:. 或者 ./ 均表示当前目录 (2)查找标准: -name 'FILENAME' 文件名精确匹配(支持通配符* ? []) -iname 'FILENAME' 文件名模糊匹配(不分大小写) -regex P

如何快速有效的定位文件系统内所需要查找的文件呢?Linux为我们提供了一些文件查找类的命令,我们需要掌握以下几个命令: http://blog.csdn.net/sailor201211/article/details/53290470 which 命令which会依照用户的PATH环境变量查找一个外部命令对应的可执行文件的路径.如: $ which gcc /usr/bin/gcc whereis 和which命令相比,whereis命令则可以定位一个外部命令的二进制文件.源代码文件及用户手册

文件查找 1,which命行查找可执行文件,which 只会搜索系统$PATH目录 2,whereis,查找可执行文件,并显示出此文件的man page文件,并且可以查找到系统的库目录 3,locate 和slocat是一样的,ubuntu14里locate为mlocate,locate是根据locate库查询的,查询速度非常的快,但是新加的文件,没有在库里的文件就无法查询,updatedb用来更新locate库 4 find为编历目录查找,如"find / -name aaa",为从

通过文件查找安装包安装缺少libstdc++6这个文件在ls /usr/lib/libstd*下有两个文件/usr/lib/libstdc++.so.6 /usr/lib/libstdc++.so.6.0.8利用rpm -rfrpm -qf /usr/lib/libstdc++.so.6这样得到这个的安装包libstdc++-4.1.2-46.el5这样就可以安装对应的包了yum install libstdc++*这样就可以了问题解决我的系统是CentOS release 5.4