[转]Fragstats软件使用及其景观生态学意义     原文地址:http://blog.163.com/shuailai@126/blog/static/132380408201041525137936/ 现在景观格局研究普遍采用Fragstats 3.3软件计算格局指数,我在写文章的过程中也使用了这一软件,期间也遇到不少问题,幸得高人指点和自己不断摸索(当时网上鲜有使用方法),终于把数据算出来了,现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来,希望对后来者有些帮助,在写这个的过程中,参考了一

引 言 FragStats景观格局分析软件 ,简单扼要地说就是景观指数的集成分析环境,不用自己编写相关的算法和读/取文件的开发.根据了解,FragStats(Fragment Statistic)官方定义为“FRAGSTATS is a computer software program designed to compute a wide variety of landscape metrics for categorical map patterns.(FRAGSTATS是一款为揭示分类图的

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今天, 天气晴朗,风和日丽: 我事实上在说谎-- 爱说谎事实上是我的天性 上个礼拜四我就用景观三元论说了非常多谎话.然后一头大象自己上吊了. 了不起的大象啊,盖茨比也要从坟墓里爬出来了吧, 陈年旧事, 紫露凝烟, 没有了盖茨比的坟墓依旧是遗址公园.景观三元论如是说. 景观三元论问:盖茨比,你为何不用C++写代码?非要用ruby或者python这样的执行非常慢的语言呢? 盖茨比说: 老兄,你要求快,干脆直接用汇编语言去写吧. 举个样例吧. 你用C++写一个实现某个功能的程序,这个程序的执行速度确实

1.打开场景,按住鼠标右键可以选择方向. 2.向前移动:W,向后移动S,亦可以用鼠标滚轮向前或者向后滚.向左A向右D, 3.Q提升视角,E下降视角. 4.鼠标滚轮点下去,进行提升和下降视角.左右移动,不过是微调,很慢.想要快可以点住SHIFT键.SHIFT加空格是最快速度. 场景小的用SHIFT,慢慢移 5.鼠标右键两下,镜头会快速切换到你指的地方,载鼠标右键两下就回去了. 6.天气系统:点击太阳,可以调节太阳方位和太阳高度. 云层的多和少可以调节,还有太阳的强度. 还可以选择云的类型. 月亮的

ArcGIS案例学习笔记2_2_等高线生成DEM和三维景观动画 计划时间:第二天下午 教程:Pdf/405 数据:ch9/ex3 方法: 1. 创建DEM SA工具箱/插值分析/地形转栅格 2. 生成三维 DEM图层/右键/属性/基本高度和夸张系数 3. 制作动画 scene图层/场景属性/启用动画旋转 结果 联系方式:谢老师,135_4855_4328,xiexiaokui#139.com  

ArcGIS案例学习笔记4_2_城乡规划容积率计算和建筑景观三维动画 概述 计划时间:第4天下午 目的:城市规划容积率计算和建筑三维景观动画 教程: pdf page578 数据:实验数据\Chp13\ex5 步骤: 1. 计算基底面积:添加字段(double),计算几何(面积) 2. 计算每栋面积:基底面积*floor 3. 添加字段 parcel_id, building_id 4. 标识建筑所属地块:分析工具/标识 5. 汇总地块建筑面积:parcel.id/汇总/每栋面积.sum 6.

文献名:Quantitative mass spectrometry to interrogate proteomic heterogeneity in metastatic lung adenocarcinoma and validate a novel somatic mutation CDK12-G879V(利用定量质谱技术探究转移性肺腺瘤的蛋白质组异质性及验证新体细胞突变CDK12-G879V) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年4月) IF:5.23

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基因调控网络的概念在之前已经简要介绍过:https://www.cnblogs.com/pear-linzhu/p/12313951.html 沃丁顿表观遗传景观(The Waddington's epigenetic landscape) 是描述基因调控下细胞分化的动态性的一个经典的隐喻,是由沃丁顿在1957年提出的.他将细胞分化比喻作从高处沿山坡滚落下的小球,直到一个稳定的盆地 (basin),该盆地也就代表一定的分化状态.小球最开始能量较高,处于不稳定状态,对应干细胞等未分化的细胞状态,小

本文首发于“生信补给站”:https://mp.weixin.qq.com/s/8kz2oKvUQrCR2_HWYXQT4g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot包绘制瀑布图,有多种展示和统计maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)和maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化,如果只有多个样本的基因突变与否的excel,不用担心,也可以用complexheatmap包绘制. 这个包功能很强大,本次只简单的介绍如何绘制基因组景观图(瀑布图).

最近需要对ecognition分割结果进行统计分析,以此来进一步判断其分割结果中的欠分割和过分割对象,在看了一篇论文后,发现了可以用一个参数H来判断每个切割对象的异质性,由于此方法需要用到arcgis和Python来配合,因此记录下. 公式大概如下: 从中可以看出,如果需要计算出参数H,我们需要先计算出每个对象的归一化方差和归一化的莫兰指数. 在计算必须的参数前,我们需要准备的数据包括: 1.原始遥感图像 2.运用ecognition进行切割后产生的标签文件和矢量文件(shp文件). 下面开始进

可使用工具包 pylandstats 此工具包基本是根据fragstats形成的,大部分fragstats里面的景观指数,这里都可以计算.但是,还是有一小部分指数这里没有涉及. LS_METRICS 自定义的aggregation index(AI)计算 原理 \[AI=\frac{e_{ii}}{max\_e_{ii}}\times100 \] 这里的\(e_{ii}\)是同类型像元公共边的个数 \(max\_e_{ii}\)是同类型像元最大公共边的个数, \(max\_e_{ii}\)的计算

部分源码选自GDAL库的官方网址:www.gdal.org,其余的代码为笔者自己编写. // readfile.cpp : 定义控制台应用程序的入口点. // /* part of the codes were cite from: http://www.gdal.org/gdal_tutorial.html and remaining of code were created :by www.cnblogs.com/AmatVictorialCuram/‎ and please mark th

1.摘要 物种形成是种群间生殖隔离的进化过程,是连续的.复杂的,涉及多个相互作用的屏障.在完成之前,这一过程的影响会随着基因组的不同而变化,并可能导致具有分化和分化波峰和波谷的异质性基因组景观.当基因流在物种形成过程中发生时,基因组中局部限制基因流的屏障会导致异质性模式.然而,基因组异质性也可以通过背景选择和选择性扫描.重组和突变率变异以及异质性基因密度等因素的变异产生或改变.从这些修饰因子中提取基因流.分化选择和生殖分离的效应对物种形成基因组学提出了重大挑战.我们认为,该领域的主要目标之一是确

资源整理. 1 Coding: 1.Python库gempy,一种基于Python的开源三维结构地质建模软件,它允许从界面和方向数据隐式(即自动)创建复杂的地质模型. 它还支持随机建模以解决参数和模型的不确定性. gempy 2.Tangram是一个JavaScript库,用于使用WebGL在Web浏览器中实时渲染2D和3D地图. tangram 3.R语言包gdalcubes R,gdalcubes的R包,与之前的gdalcubes包区别在哪,目前不确定.但都是用于处理栅格大数据的. gdal

照例,老周在开始吹牛之前,先讲讲小故事,这是朋友提出的建议,老TMD写技术有什么了不起的,人人都会写.后来老周想想,也确实,代码谁不会写,能写到有品位有感悟,就不容易做到.于是,老周接受了该朋友的建议. 有初入职场的弟弟妹妹们经常诉苦,为啥,因为常常被人骂,被老员工骂,被老板骂.好像自己做的事永远都是错的,于是感觉很受打击,很伤心. 这里老周必须提醒各位,小伙子应该坚强一点,小妹妹们也不要过于绝望,千万不要因为这些事情去做傻事.西湖景观很美,“欲把西湖比西了,淡妆浓抹总相宜”,但是,如果有人跳西

在我们的现实生活中,许多复杂系统都可以建模成一种复杂网络进行分析,比如常见的电力网络.航空网络.交通网络.计算机网络以及社交网络等等.复杂网络不仅是一种数据的表现形式,它同样也是一种科学研究的手段.复杂网络方面的研究目前受到了广泛的关注和研究,尤其是随着各种在线社交平台的蓬勃发展,各领域对于在线社交网络的研究也越来越火.研究生期间,本人的研究方向也是一直与复杂网络打交道,现在马上就要毕业了,写一篇博文简单介绍一下复杂网络特点以及一些有关复杂网络研究内容的介绍,希望感兴趣的博友可以一起讨论,一起学

移动web在当今的发展速度是一日千里,作为移动领域的门外汉,在这段时间的接触后,发现前端开发这一块做一个小小的总结. 1.四大浏览器内核 1.Trident (IE浏览器) :因为在早期IE占有大量的市场份额,所以以前有很多网页是根据这个Trident的标准来编写的,但是实际上这个内核对真正的网页标准支持不是很好,同时存在许多安全Bug. 2.Gecko:( FireFox )优点就是功能强大.丰富,可以支持很多复杂网页效果和浏览器扩展接口,缺点是消耗很多的资源,比如内存. 3.Webkit: