Mask R-CNN用于目标检测和分割代码实现 Mask R-CNN for object detection and instance segmentation on Keras and TensorFlow 代码链接:https://github.com/matterport/Mask_RCNN 这是基于Python 3,Keras和TensorFlow 的Mask R-CNN的实现.该模型为图像中对象的每个实例生成边界框和分割masks.基于功能金字塔网络Feature Pyramid N

转载:http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/39213817 背景: 上一篇专栏博文中针对PACS终端(或设备终端,如CT设备)与RIS系统之间worklist查询进行了介绍,并着重对比分析了DICOM3.0中各部分对DICOM网络通讯服务的定义.此次通过结合早些时间的博文DICOM医学图像处理:基于DCMTK工具包学习和分析worklist,对DCMTK开源库中提供的storescp.exe和storescu.exe工具的源码进行剖析,从底

背景: 从DICOM网络传输一文开始,相继介绍了C-ECHO.C-FIND.C-STORE.C-MOVE等DIMSE-C服务的简单实现,博文中的代码给出的实例都是基于fo-dicom库来实现的,原因只有一个:基于C#的fo-dicom库具有高封装性.对于初学者来说实现大多数的DIMSE-C.DIMSE-N服务几乎都是“傻瓜式”操作——构造C-XXX-RQ.N-XXX-RQ然后绑定相应的OnResponseReceived处理函数即可.本博文希望在前几篇预热的基础上,对比DCMTK.fo-dico

背景介绍: 近期项目需求,须要使用C#进行最新的UI和相关DICOM3.0医学图像模块的开发.在C++语言下,我使用的是应用最广泛的DCMTK开源库,在本专栏的起初阶段的大多数博文都是对DCMTK开源库的介绍和学习.眼下因为项目须要,现開始对mDCM开源库继续学习分析,因此本专栏接下来的文章会大多以mDCM开源库为例进行医学图像的解说,DCMTK因为是C++语言开发的,所以作为我学习和剖析mDCM开源库的原始根据,我们并未放弃对DCMTK开源库的学习,而是通过更加细致的研读和分析DCMTK的C+

18年下半年10月份左右,老师分配有关NiftyNet平台的相关学习的任务,时隔5个月,决定整理一下以前的笔记,写成相应的博客! 目录 1.NiftyNet平台简介 2.NiftyNet平台架构设计 3.NiftyNet安装平台 4.利用NiftyNet平台实现一个自带的Demo 5.NiftyNet文档介绍 1.NiftyNet平台简介 (1)NiftyNet是一款开源的卷积神经网络平台,专门针对医学图像处理分析以及医学影像指导治疗,由WEISS (Wellcome EPSRC Centre

为了便于学习图像处理并研究图像算法, 俺写了一个适合初学者学习的小小框架. 麻雀虽小五脏俱全. 采用的加解码库:stb_image 官方:http://nothings.org/ stb_image.h用于解析图片格式: JPG, PNG, TGA, BMP, PSD, GIF, HDR, PIC stb_image_write.h用于保存图片格式: PNG, TGA, BMP, HDR 附带处理耗时计算,示例演示了一个简单的反色处理算法,并简单注释了一下部分逻辑. 完整代码: #include

转载:http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/41424027 背景: 此篇博文介绍一个开源的.基于WEB的DICOM Server软件.该开源软件完全使用C++编写,不依赖于第三方数据库(内置了SQLite数据库)或其他框架,支持RESTful API设计模式.官网上提供了源代码,同时也给出了编译后的Windows和Linux系统的二进制安装包.Orthanc是PACS领域的一种改革,提出了“解构PACS概念”,即Deconstructed

背景: Orthanc是博主发现的一个很完美的DICOM和HTTP服务端开源软件,前几篇分别介绍了Orthanc的基本使用.Orthanc从0.8.0版本之后给出了Plugin SDK,通过该SDK可以利用Orthanc内建的REST API实现WADO服务,下面就参照官网给出的说明介绍一下如何使用SDK实现WADO服务,并且对官网的实例进行更新,采用最新的方式直接实现WADO服务. 官方说明中文翻译: 1)简介 DICOM标准定义了文件格式以及医学影像网络传输协议.WADO,即Web Acce

背景: 此篇博文介绍一个开源的.基于WEB的DICOM Server软件.该开源软件完全使用C++编写,不依赖于第三方数据库(内置了SQLite数据库)或其他框架,支持RESTful API设计模式.官网上提供了源代码,同时也给出了编译后的Windows和Linux系统的二进制安装包.Orthanc是PACS领域的一种改革,提出了“解构PACS概念”,即Deconstructed PACS,用户可以通过三种方式访问Orthanc:DICOM Server.Web Server和RESTful A

如和将class中定义的变量打印或读取出来,受maskrcnn的config.py的启示,我将对该函数进行解释. 我将介绍该函数前,需要对一些名词进行解释,如下: ①Ipython:ipython是一个python的交互式shell,比默认的python shell好用得多,支持变量自动补全,自动缩进,支持bash shell命令,内置了许多很有用的功能和函数.学习ipython将会让我们以一种更高的效率来使用python.同时它也是利用Python进行科学计算和交互可视化的一个最佳的平台. ②

我已经根据resize_image()函数的解析对原图像与resize图像进行了解析, 若有读者想对原图像与目标图像不同尺寸验证,可根据以下代码,调整函数参数, 其细节如下: import cv2 as cvimport numpy as npimg=cv.imread('D:\\MASKRCNN\\mask-rcnn-me\\MASKRCNN_myself\\0.bmp')def resize_image(image, min_dim=230, max_dim=220, min_scale=2

我以为只有box能计算iou值,但我看了maskrcnn后,发现该模型对mask进行了iou的计算,该方法巧妙之处在于 mask1与mask2必须有相同的height and width,而后在同一个位置的值累加,即交叉面积,而后将mask1与mask2 所有值累加为并集,而后计算类似于box的iou计算了. 然而,我为了简化,将变量a看作mask,并将mask1与mask2均等于a,以下是详细代码: import numpy as npa=np.array([[1,0,1,0,1,1],[1,

[视频处理]YUV与RGB格式转换 YUV格式具有亮度信息和色彩信息分离的特点,但大多数图像处理操作都是基于RGB格式. 因此当要对图像进行后期处理显示时,需要把YUV格式转换成RGB格式. RGB与YUV的变换公式如下: YUV(256 级别) 可以从8位 RGB 直接计算: Y = 0.299 R + 0.587 G + 0.114 B U = - 0.1687 R - 0.3313 G + 0.5 B + 128 V = 0.5 R - 0.4187 G - 0.0813 B + 128

会议: Information Processing in Medical Imaging,IPMI IPMI2013 International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention,MICCAI MICCAI2014  MICCAI2010 MICCAI2002 International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 期刊: Medica

背景: 近期因为项目须要,将原本的开发IDE环境由VS2008升级到了VS2012.本以为编译完毕后的DCMTK开源库能够直接从VS2008移植到VS2012.可是通过项目属性加入完包括文件夹和依赖库后,编译会出现大量的链接错误(大多是跟dcmdata.lib.oflog.lib有关). 解决方法: 又一次依照原本的博客前辈柳北风儿(大神眼下已经博客转移到网易:http://blog.163.com/qimo601@126/),利用CMake工具,选择VS2012本地编译器对DCMTK3.6.0

采用Decoder:stb_image https://github.com/nothings/stb/blob/master/stb_image.h 采用Encoder:tiny_jpeghttps://github.com/serge-rgb/TinyJPEG/blob/master/tiny_jpeg.h stb_image.h用于解析图片格式: JPG, PNG, TGA, BMP, PSD, GIF, HDR, PIC tiny_jpeg.h用于保存JPG格式. 附带处理耗时计算,示例

背景: 预告了好久的几篇专栏博文一直没有整理好,主要原因是早前希望搭建的WML服务器计划遇到了问题.起初以为参照DCMTK的官方文档wwwapp.txt结合前两天搭建的WAMP服务器可以顺利的实现WML服务,借此就可以同时完成WEB PACS系列以及搭建Dicom WML服务器的两篇博文.可是在实际部署过程中发现了几个严重的问题,一时无法解决.但是在搜索解决方案的时候,偶然间找到了在DCMTK论坛上贴出来的用PHP对DCMTK工具包封装的文章.因此此篇博文在记录搭建WML遇到的问题的同时,主要想

背景: 周末看到了一篇原公司同事的文章,讲的是关于新的互联网形势下的PACS系统.正好上一篇专栏文章也提到了有想搭建一个worklist服务器的冲动,所以就翻箱倒柜将原本学生时代做课题时搭建的简易Web PACS找了出来,借着再次搭建的机会学习一下Web PACS相关的技术,例如WADO标准.CGI或者FastCGI等技术. WEB PACS技术浅谈: WEB PACS是一种利用互联网技术,跨越了医院和地域限制的,可随意查询和获取DICOM对象的PACS系统.目前常见的方式有两种:第一种是通过W

背景: 如前一篇专栏博文所述,借助于CGI或FastCGI技术转发浏览器发送过来的用户请求,启动本地的DCMTK和CxImage库响应.然后将处理结果转换成常规图像返回到浏览器来实现Web PACS.本博文通过实际的代码測试来验证这一模式的可行性,同一时候对C语言编写CGI脚本提出了一些问题. 难题: 计划參照DCMTK自带工具dcm2pnm.exe的源代码.通过DicomImage将DCM文件转换成BMP文件,然后利用CGI技术返回到浏览器.实现一次简单的WEB PACS的影像传输模拟.详细的

背景: 上一篇博文简单翻译了Orthanc官网给出的CodeProject上“利用Orthanc Plugin SDK开发WADO插件”的博文,其中提到了Orthanc从0.8.0版本之后支持快速查询,而原本的WADO请求需要是直接借助于Orthanc内部的REST API逐级定位.那么为什么之前的Orthanc必须要逐级来定位WADO请求的Instance呢?新版本中又是如何进行改进的呢?此篇博文通过分析Orthanc内嵌的SQLite数据库,来剖析Orthanc的RESTful API机制,

背景: 上篇博文为引子,介绍了一款神奇的开源PACS系统——Orthanc.本篇开始解读官方Cookbook中的相关内容,对于简单的浏览.访问和上传请阅读前篇博文.在常规的PACS系统中还未出现对于DCM图像的修改和匿名化操作,因此此次重点介绍Orthanc利用REST API实现对DCM医学图像的修改(modification)和匿名化(anonymization).对于官方Cookbook中的实例进行示范和调试,通过Orthanc源码分析确保示例在本机良好运行.注意:官方Cookbook中的