目录 1.混合测序基础 2. 点突变检测 3. BSA 4. BSR 5. 混合样本GWAS分析 6. 混合样本驯化研究 7. 小结 1.混合测序基础 测序成本虽然下降了,但对于植物育种应用研究来说还是很高,动不动就上百群体,小小植物个体价值又低,测完了很可能后面就用不到了.这时,混合样本测序是一种省钱的好办法. 混池测序(Pool-seq)相对于GWAS或其他精细定位策略而言,其实是一个初定位产品,其结果很有可能是跟性状相关的候选区域. 概念: 混合样本测序一般是选择表型极端或目标性状差异的个

概要 在前面一章"Java多线程系列--"JUC线程池"02之 线程池原理(一)"中介绍了线程池的数据结构,本章会通过分析线程池的源码,对线程池进行说明.内容包括:线程池示例参考代码(基于JDK1.7.0_40)线程池源码分析(一) 创建"线程池"(二) 添加任务到"线程池"(三) 关闭"线程池" 转载请注明出处:http://www.cnblogs.com/skywang12345/p/3509954.h

在上一章"Java多线程系列--"JUC线程池"01之 线程池架构"中,我们了解了线程池的架构.线程池的实现类是ThreadPoolExecutor类.本章,我们通过分析ThreadPoolExecutor类,来了解线程池的原理.内容包括:ThreadPoolExecutor简介ThreadPoolExecutor数据结构线程池调度 转载请注明出处:http://www.cnblogs.com/skywang12345/p/3509941.html ThreadPo

1.固定内存池管理实验 内存管理是操作系统的一个基础功能.uTenux的内存池管理函数提供了基于软件的内存池管理和内存块分配管理.uTenux的内存池有固定大小的内存池和大小可变的内存池之分,它们被看成是互相独立的对象,需要不同的系统调用集来进行操作. 内存池管理函数管理的内存全部包含在系统空间以内. 1.固定尺寸内存池实验 固定尺寸内存池是一个用来动态管理固定尺寸内存块的对象.每个固定尺寸内存池都有一个用作固定尺寸内存池的内存空间(简称为内存池区)和一个等待内存块分配的任务队列. uTenux

Commons-pool是一个apache开源组织下的众多项目的一个.其被广泛地整合到众多需要对象池功能的项目中. 官网:http://commons.apache.org/proper/commons-pool/ 本文是commons-pool的一个简单应用,包括不带key的池和带key的池.带key的池是把key相同的池对象放在一起池里,也就是说有多少个key就有多少个池. 不带key的池是生产完全一致的对象放在池里,但是有时候,单用对池内所有对象一视同仁的对象池,并不能解决的问题.例如,对

抛出样例: Integer a1  = new Integer(123);        Integer a2  = new Integer(123);        System.out.println(a1 == a2);   //false  因为只要遇到new关键词,肯定会在堆里面重新分配空间给实例对象,所以两个地址肯定不同                a1  = 123;        a2  = 123;        System.out.println(a1 == a2); 

1.java中为什么要使用多线程使用多线程,可以把一些大任务分解成多个小任务来执行,多个小任务之间互不影像,同时进行,这样,充分利用了cpu资源.2.java中简单的实现多线程的方式 继承Thread类,重写run方法;class MyTread extends Thread{ public void run() { System.out.println(Thread.currentThread().getName()); } }实现Runable接口,实现run方法:class MyRunna

WebSphere 中池资源调优 - 线程池.连接池和 ORB 来自:https://www.ibm.com/developerworks/cn/websphere/library/techarticles/1106_zhuxl_websphereenhancement/1106_zhuxl_websphereenhancement.html IBM WebSphere Application Server (以下简称 WAS)能支持的应用程序越来越多,而这些应用程序有各自的独特特性.需求和服务

一.为什么我们要用连接池技术? 前面的数据库连接的建立及关闭资源的方法有些缺陷.统舱传统数据库访问方式:一次数据库访问对应一个物理连接,每次操作数据库都要打开.关闭该物理连接, 系统性能严重受损. 解决方案:数据库连接池(Connection Pool). 系统初始运行时,主动建立足够的连接,组成一个池.每次应用应用程序请求数据库连接时,无需重新打开连接,而是从池中取出已有的连接,使用完后,不再关闭,而是归还. 二.连接池主要由三部分组成:连接池的建立.连接池中连接的使用管理.连接池的关闭. 三

Start with JVM 周志明先生著-<深入理解Java虚拟机>,书买回来好几天了,但是最近才准备开始搞一搞了(哭瞎…..).首先是第一章的Java以及JVM发展历史,大概知道了现行的应用最广泛的Java虚拟机是HotSpot,当然一些商业公司也有使用自己的虚拟机. JVM运行时数据区 这是放在Java内存区域与内存溢出异常里面的必备知识,描述了Java虚拟机在运行时的数据区域 ↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓ 私有 - 程序计数器:记录当前线程所执行字

<Thread之一:线程生命周期及五种状态> <juc线程池原理(四): 线程池状态介绍> 线程有5种状态:新建状态,就绪状态,运行状态,阻塞状态,死亡状态.线程池也有5种状态:然而,线程池不同于线程,线程池的5种状态是:Running, SHUTDOWN, STOP, TIDYING,TERMINATED. 线程池状态定义代码如下: private final AtomicInteger ctl = new AtomicInteger(ctlOf(RUNNING, 0)); pr

你创建线程池最好分为两种线程池,io密集型线程池,或者cpu密集型线程池. 否则,如果只用一个线程池的话,不管是iO密集的线程,或者cpu消耗大的都放在同一个线程池的话,会发生线程池被撑满的情况

线程池的作用: 线程池作用就是限制系统中执行线程的数量.     根据系统的环境情况,可以自动或手动设置线程数量,达到运行的最佳效果:少了浪费了系统资源,多了造成系统拥挤效率不高.用线程池控制线程数量,其他线程 排队等候.一个任务执行完毕,再从队列的中取最前面的任务开始执行.若队列中没有等待进程,线程池的这一资源处于等待.当一个新任务需要运行时,如果线程 池中有等待的工作线程,就可以开始运行了:否则进入等待队列. 为什么要用线程池: 减少了创建和销毁线程的次数,每个工作线程都可以被重复利用,可执

线程池是一种多线程处理形式,处理过程中将任务加入到队列,然后在创建线程后自己主动启动这些任务.线程池线程都是后台线程.每一个线程都使用默认的堆栈大小,以默认的优先级执行.并处于多线程单元中. 假设某个线程在托管代码中空暇(如正在等待某个事件),则线程池将插入还有一个辅助线程来使全部处理器保持繁忙. 假设全部线程池线程都始终保持繁忙,但队列中包括挂起的工作,则线程池将在一段时间后创建还有一个辅助线程但线程的数目永远不会超过最大值.超过最大值的线程能够排队,但他们要等到其它线程完毕后才启动. 组成部

线程池和连接池   线程池的原理:     来看一下线程池究竟是怎么一回事?其实线程池的原理很简单,类似于操作系统中的缓冲区的概念,它的流程如下:先启动若干数量的线程,并让这些线程都处于睡眠状态,当客户端有一个新请求时,就会唤醒线程池中的某一个睡眠线程,让它来处理客户端的这个请求,当处理完这个请求后,线程又处于睡眠状态. 为什么要使用线程池: 高峰期客户端请求并发量大,如果为每个客户端请求创建一个新线程的话,那耗费的CPU时间和内存将是惊人的,如果采用一个拥有多个线程的线程池,那将会节约大量的的

Class常量池.运行时常量池.字符串常量池 class常量池 java代码经过编译之后都成了xxx.class文件,这是java引以为傲的可移植性的基石.class文件中,在CAFEBABE.主次版本号之后就是常量池入口了,入口是一个u2类型的数据,也就是占据2个字节,用来给常量池的容量计数,假设这个u2的数字为0x0016,那么对应十进制为22,那么常量池中右21个常量,1-21,其中第0个用于表达"不引用任何一个常量".在这两个字节之后就是编译器为我们生成的常量了,这些常量包含了

彻底搞清楚class常量池.运行时常量池.字符串常量池 常量池-静态常量池 也叫 class文件常量池,主要存放编译期生成的各种字面量(Literal)和符号引用(Symbolic References). 字面量:例如文本字符串.fina修饰的常量. int b = 2; int c = "abcdefg"; 符号引用:例如类和接口的全限定名.字段的名称和描述符.方法的名称和描述符 // 第3部分,常量池信息 Constant pool: 常量池-运行时常量池 当类加载到内存中后,J

JVM内存分配 先了解下JVM中的内存分配,此处以hotspot vm为例(官方jdk采用的vm) 程序计数器 栈 1. 虚拟机栈 2. 本地方法栈 Java堆 堆内存是各个线程共享的区域 方法区 它用于存储已经被虚拟机加载的类信息.常量.静态变量.即编译器编译后的代码等数据.静态变量.常量在方法区,所有方法,包括静态和非静态的,也在方法区 这里解释一下方法区: 首先方法区不是在堆中,在java8之前是用永久代实现的,永久代是 Hotspot 虚拟机特有的概念,虽然 Java 虚拟机规范把方法区

发一个可伸缩线程池大小的线程池. 当任务不多时候,不开那么多线程,当任务多的时候开更多线程.当长时间没任务时候,将线程数量减小到一定数量. java的Threadpoolexcutor可以这样,py的不行,修改成具备这样特性的线程池. """ 可自动实时调节线程数量的线程池. """ import atexit import queue import sys import threading import time import weakref

概要 本章介绍线程池的拒绝策略.内容包括:拒绝策略介绍拒绝策略对比和示例 转载请注明出处:http://www.cnblogs.com/skywang12345/p/3512947.html 拒绝策略介绍 线程池的拒绝策略,是指当任务添加到线程池中被拒绝,而采取的处理措施.当任务添加到线程池中之所以被拒绝,可能是由于:第一,线程池异常关闭.第二,任务数量超过线程池的最大限制. 线程池共包括4种拒绝策略,它们分别是:AbortPolicy, CallerRunsPolicy, DiscardOld

转载请注明出处:http://www.cnblogs.com/skywang12345/p/3509960.html 本章介绍线程池的生命周期.在"Java多线程系列--"基础篇"01之 基本概念"中,我们介绍过,线程有5种状态:新建状态,就绪状态,运行状态,阻塞状态,死亡状态.线程池也有5种状态:然而,线程池不同于线程,线程池的5种状态是:Running, SHUTDOWN, STOP, TIDYING, TERMINATED. 线程池状态定义代码如下: priv