前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了,网红教授宣传得很成功,功能也比较强大,主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化.简单总结下用法,以后用时可直接找来用. 首先考虑一个问题:clusterProfiler做GO和KEGG富集分析的注释信息来自哪里? GO的注释信息来自Bioconductor,提供了19个物种的org类型的GO注释信息,如下表所示.Bioconductor中更多的注释包可参考http://www.bioconductor.org/packages/rel

ls -R #include <sys/stat.h> #include <dirent.h> #include <fcntl.h> #include <stdbool.h> #include <stdio.h> int do_ls(const char *dir) { ]; DIR *dirp; struct dirent *dp; struct stat dir_stat; != access(dir, F_OK) ) { ; } >

r.js是requireJS的优化(Optimizer)工具,可以实现前端文件的压缩与合并,在requireJS异步按需加载的基础上进一步提供前端优化,减小前端文件大小.减少对服务器的文件请求.要使用r.js需下载r.js文件(点我下载),将其放到你的项目根目录:还需要安装nodeJS(点我下载),以便通过命令行来执行r.js功能.我们将拿一个小案例来详细说明使用r.js的方法(你可以点此下载这个案例). 如下图所示的项目(见案例中的before文件夹)仅仅使用了requireJS,但还未使用过

R软件功能非常强大,可以很好的进行各类统计,并能输出图形.下面介绍一种R语言和C#进行通信的方法,并将R绘图结果显示到WinForm UI界面上. 1 前提准备 安装R软件,需要安装32位的R软件,64位的调用会报错.另外就是讲R添加到电脑环境变量中. 打开R软件,安装包 scatterplot3d,演示需要用到此R包. 2 创建项目GraphGenerateByR,项目结构如下: 注意这里需要引入RDotNet类库,可以自行下载:http://rdotnet.codeplex.com/ 3 M

如何开始使用 Tableau 与 R? 对于已经熟悉 R 及其功能的用户而言,在 R 与 Tableau 之间建立连接非常简单.以 下说明适用于基于开源版 R 的新安装.其他一些方案也可能使用其他程序包,例如来自 Revolution Analytics 的程序包. 下载并安装 R.单击此处查找有关下载 R 的文件和说明. 下载并安装 Rserve.为了使用新的脚本函数,您需要安装一个 Rserve 用来连接 Tableau.在 R 控制台中输入以下命令:  install.packages("

https://www.r-project.org/ http://cos.name/2013/08/r-rjava-java/ http://blog.csdn.net/hwssg/article/details/39177959 目录 rJava介绍 rJava安装 rJava实现R调用Java rJava(JRI)实现Java调用R (win7) rJava(JRI)实现Java调用R (Ubuntu) 1. rJava介绍 rJava是一个R语言和Java语言的通信接口,通过底层JNI实

LINUX命令的cp -r 和-R的区别 功能上是等价的.不加-r或者-R的时候,只拷贝文件,不拷贝文件夹:加上后则会拷贝文件夹——包括下一级的子文件夹,以及子文件夹中的子文件夹,余此类推.rm的-R -r功能同上ls的-R功能同上,-r的功能是结果反向排列

#安装R语言R3.3版本会出现各种so不存在的问题,退回去到R3.1版本时候就顺利安装.在安装R环境之前,先安装好中文(如果没有的话图表中显示汉字成框框了)和tcl/tk包(少了这个没法安装sqldf)sudo yum install fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel -y安装中文字体后重新加载 service xfs reload (不过在有台机器上总是失败,后来重启机器OK)sudo service xfs reload有些包会需要rg

R是开源的软件工具,很多R语言用户和爱好者都会扩展R的功能模块,我们把这些模块称为包.我们可以通过下载安装这些已经写好的包来完成我们需要的任务工作. 包下载地址:https://cran.r-project.org/web/packages/ 包是R函数.数据.预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合.计算机上存储包的目录称为库(library),函数.library()显示库的位置.R自己有一些默认的包,其他的需要我们自己下载安装,安装完成后必须加载到当前会话中才能被使用.可以使用命令sear

R语言 R是用于统计分析.绘图的语言和操作环境.R是属于GNU系统的一个自由.免费.源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具. 特点介绍 •主要用于统计分析.绘图.数据挖掘 •R内置多种统计学及数字分析功能.R的功能也可以通过安装包(Packages,用户撰写的功能)增强. •因为S的血缘,R比其他统计学或数学专用的编程语言有更强的面向对象(面向对象程序设计)功能 官网:http://cran.r-project.org/ 其他介绍 •R的另一强项是绘图功能,制图具有印刷的素质

要学的东西太多,无笔记不能学~~ 欢迎关注公众号,一起分享学习笔记,记录每一颗"贝壳"~ --------------------------- 看了看往期的博客,这个话题竟然是第一次涉及,还真是学无止境啊. Web Service 这个概念比较成功了, 在SOAP服务之后, Restful服务的普及, 使得数据库的CRUD操作通过网络无限延伸. 普遍的好处是: 1) 你不需要安装任何程序, 携带数据, 只要有网的地方, 你就能演示.(远程) 2) 只要安装一次, 可以多人使用, 可以

贡献文件 注意: 贡献文件的CRAN区域被冻结,不再被主动维护. 英文 --- 其他语言 手册,教程等由R用户提供.R核心团队对内容不承担任何责任,但我们非常感谢您的努力,并鼓励大家为此列表做出贡献!要提交,请按照CRAN主页上的提交说明进行操作.以下所有材料均可从CRAN直接获得,您也可以查看互联网上其他R文档的列表 . 注意: 请使用目录列表按名称,大小或日期排序(例如,查看哪些文档已更新). 英文文件 超过100页的文件: “视觉统计.使用R!“ by Alexey Shipunov(PD

前言 这一章讲了程序设计的相关知识,经过了: 算法分析 编码 得到最后的程序. if 语句 格式:if (this) {that} else if { another} else { another another} 双运算符 && .|| && 和 || 与 & 和 | 的不同之处在于:&& 和 || 存在短路现象,因此能够提高代码的运行效率局限性是:两侧只能是单个的逻辑测试 逻辑测试语句实例 判断三个值是否相等 方法一:symbols[1] ==

主要分成三大类: r 和 r+     "读"功能 r  只读 r+ 读写(先读后写) 辨析:对于r,只有读取功能,利用光标的移动,可以选择要读取的内容. 对于r+,同时具有读和写的功能,默认光标一开始停在开头,当进行一个操作后(无论是读还是写)光标将自动移动到末尾.写的功能如果在末尾就是添加;如果在原文本中就是修改!!! w 和 w+   "写"功能 w 只写 w+       写读(先写后读) 辨析:两个都有写的功能,只要进行操作,一定是先自动清空,再写入,慎用

在R的官方教程里是这么给R下注解的:一个数据分析和图形显示的程序设计环境(A system for data analysis and visualization which is built based on S language.). R的源起 R是S语言的一种实现.S语言是由 AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索.统计分析.作图的解释型语言.最初S语言的实现版本主要是S-PLUS.S-PLUS是一个商业 软件,它基于S语言,并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善.后来Auc

R的优点:免费,开源,体积小.缺点:对大文本处理差,另外一个也在于开源,package如果出错,烦死你.当你跑比较大的simulation,对效率有要求的时候,有时还是不得不用C,这可能是10小时和10分钟的差别,毫不夸张.SAS流行于公司,R流行于研究机构和大学数据分析不是单纯的靠软件来做的,需要很好的数学基础. 统计学工具各有千秋.https://englianhu.wordpress.com/statistics/学了R,可以免去学spss,matalab,ucinet等等众多的软件,可以

简单介绍 watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center" alt="" />语言是主要用于统计分析.画图的语言和操作环境. R本来是由来自新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和Robert Gentleman 开发. (也因此称为R)如今由"R开发核心团队"负责

为了鼓励新工具的出现,机器学习和数据分析领域似乎已经成了“开源”的天下.Python 和 R 语言都具有健全的生态系统,其中包括了很多开源工具和资源库,从而能够帮助任何水平层级的数据科学家展示其分析工作. 机器学习和数据分析之间的差异有些难以言明,但二者最主要的不同就在于,比起模型的可解释性,机器学习更加强调预测的准确性:而数据分析则更加看重模型的可解释性以及统计推断.Python ,由于更看重预测结果的准确性,使其成为机器学习的一把利器. R ,作为一种以统计推断为导向的编程语言,在数据分析界

文件操作简介:使用python来读写文件是非常简单的操作.我们使用 open() 函数来打开一个文件,获取到文件句柄.然后通过文件句柄就可以进行各种各样的操作了.根据打开⽅方式的不同能够执行的操作也会有相应的差异.打开文件的方式: r, w, a, r+, w+, a+, rb, wb, ab, r+b, w+b, a+b 默认使⽤用的是r(只读)模式 相对路径 绝对路径:绝对路径:从磁盘根目录开始寻找到文件目录 如:E:\Python_workspace\t\n\王尼玛.txt相对路径:从文件

众所周知R软件功能非常强大,可以很好的进行各类统计,并能输出图形.下面介绍一种R语言和C#进行通信的方法,并将R绘图结果显示到WinForm UI界面上的方法,文中介绍的很详细,需要的朋友可以参考下. 一.前提准备 安装R软件,需要安装32位的R软件,64位的调用会报错.另外就是讲R添加到电脑环境变量中. 打开R软件,安装包 scatterplot3d,演示需要用到此R包. 二.创建项目GraphGenerateByR,项目结构如下: 注意:这里需要引入RDotNet类库,可以自行下载:http

摘自 方匡南 等编著<R数据分析-方法与案例详解>.电子工业出版社 R包简介 R包提供了一个加载所需代码.数据和文件的集合.R软件自身就包含大约30种不同功能的包,这些基本包提供了R软件的基本功能.与此同时,R作为一个开源软件,它提供了各种统计计算函数,从而方便使用者能够灵活机动的进行数据分析,甚至创造出符合特定需要的新统计计算方法,而这些函数大多是以包的形式提供,这些都是世界各地R用户自己编写的,并上传到网上分享.因此,制作出属于用户自己的R包,并与全世界的R用户共享是一件非常有意思的事情.