1)samtools简介--------------------------------------------------------------------------背景:前面我们讲过sam/bam格式,sam文件虽然是可读的文本文件形式,但是通常是非常大,因此一般会对其压缩来节省磁盘空间,且对于很多软件来说,相比于对sam文件,对bam文件进行处理更加有效.SAMtools 是一款优秀的用以解析.处理sam/bam格式文件的一种软件包工具.其详细的文档可以在其官网里面找到.它主要包含以下

命令行: 1,git log: 2,git diff 版本号码 窗口类型: 1,sudo apt-get install gitk 2,gitk

R语言建立回归分析,并利用VIF查看共线性问题的例子 使用R对内置longley数据集进行回归分析,如果以GNP.deflator作为因变量y,问这个数据集是否存在多重共线性问题?应该选择哪些变量参与回归? >>>> 答 ## 查看longley的数据结构 str(longley) ## 'data.frame':    16 obs. of  7 variables: ##  $ GNP.deflator: num  83 88.5 88.2 89.5 96.2 ... ##  

http://www.fungenomics.com/article/30 [专题]基因组学技术专题(二)-- 为什么说FPKM/RPKM是错的 下载数据 wget是linux下一个从网络上自动下载文件的常用自由工具.它支持HTTP,HTTPS和FTP协议,可以使用HTTP代理.一般的使用方法是: wget + 空格 + 参数 + 要下载文件的url路径,例如: 1wget http://www.linuxsense.org/xxxx/xxx.tar.gz Wget常用参数 -b:后台下载,W

一直以来非常庆幸曾经有翻过<代码大全2>:这使我崎岖编程之路少了很多不必要的坎坷.它在软件工艺的话题中有写到一篇:"首先是为人写程序,其次才是机器(Write Programs for People First, Computers Second)".虽然这是针对代码可读性来谈及的,但这间接昭示了开发效率之重要不是?此次以 Vue , Es6, Jade, Scss , Webpack, Gulp等一套强大组合来改善团队前端工作流,首因即出于这个理念. 微注:如此处排版不尽

原文:http://blog.chinaunix.net/uid-22414998-id-3265685.html OpenStack云计算----快速入门(2) 该教程基于Ubuntu12.04版,它将帮助读者建立起一份OpenStack最小化安装. 第二部分 OpenStack安装与配置 一.引言 本章内容讲解如何在3台物理机上搭建最小化云平台,这3台机器分为称为Server1.Server2和Client1,之后的各章也是如此.Server1承载着Nova.Glance.Swift.Key

今天在系统集成测试时由测试人员提交了一个测试bug,原因是提交业务数据时间与实际时间(北京时间)有偏差,导致统计异常.由于我们集成测试是向测试人员直接提供完整的Docker镜像作为测试环境,原因应该是出在容器时间设置上.   拿到交付的docker镜像后,启动后进入容器控制台,使用date命令查看果然时间不正确.再查看宿主机时间是正确,这样肯定是容器启动时未将时区与宿主机保持同步了,由于测试镜像是由dockfile直接构建,因此问题基本了定准在dockerfile文件上了.   打开docker

在市场研究中,有一种分析是研究消费者态度或偏好,收集的数据是某些对象的评分数据,这些评分数据可以看做是对象间相似性或差异性的表现,也就是一种距离,距离近的差异性小,距离远的差异性大.而我们的分析目的也是想查看这些对象间的差异性或相似性情况,此时由于数据的组成形式不一样,因此不能使用对应分析,而需要使用一种专门分析此问题的方法——多维尺度分析(MDS模型).多维尺度分析和对应分析类似,也是通过可视化的图形阐述结果,并且也是一种描述性.探索性数据分析方法. 基于以上,我们可以得知,多维尺度分析经常使

来源:http://hukai.me/android-performance-patterns/#jtss-tsina 0)Render Performance 大多数用户感知到的卡顿等性能问题的最主要根源都是因为渲染性能.从设计师的角度,他们希望App能够有更多的动画,图片等时尚元素来实现流畅的用户体验.但是Android系统很有可能无法及时完成那些复杂的界面渲染操作.Android系统每隔16ms发出VSYNC信号,触发对UI进行渲染,如果每次渲染都成功,这样就能够达到流畅的画面所需要的60

2015年伊始,Google发布了关于Android性能优化典范的专题,一共16个短视频,每个3-5分钟,帮助开发者创建更快更优秀的Android App.课程专题不仅仅介绍了Android系统中有关性能问题的底层工作原理,同时也介绍了如何通过工具来找出性能问题以及提升性能的建议. 主要从三个方面展开,Android的渲染机制,内存与GC,电量优化.下面是对这些问题和建议的总结梳理.  0)Render Performance 大多数用户感知到的卡顿等性能问题的最主要根源都是因为渲染性能.从设计

一.本文目的        演示在一台机器上搭建3主3从的redis集群,通过演示了解redis集群的搭建,使用和注意事项     二.搭建说明        1.同一台机器搭建3主3从的伪集群        2.使用端口7111~7116,集群端口为端口前+1,如果使用端口7111,则其集群通信端口为17111,              redis.config的配置如下: daemonize port pidfile logfile cluster-enabled cluster-conf

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reference to : http://www.cnblogs.com/hanyonglu/p/4244035.html#undefined 2015年伊始,Google发布了关于Android性能优化典范的专题,一共16个短视频,每个3-5分钟,帮助开发者创建更快更优秀的Android App.课程专题不仅仅介绍了Android系统中有关性能问题的底层工作原理,同时也介绍了如何通过工具来找出性能问题以及提升性能的建议. 主要从三个方面展开,Android的渲染机制,内存与GC,电量优化.下

上午登录服务器编译运行服务端程序的时候,学到了在命令后加上字符“&”后,退出shell,运行的命令可以继续运行.不解原因,并到网上搜索了以下,明白了点! 以下是搜索到的片段: & 放在启动参数后面表示设置此进程为后台进程 默认情况下,进程是前台进程,这时就把Shell给占据了,我们无法进行其他操作,对于那些没有交互的进程,很多时候,我们希望将其在后台启动,可以在启动参数的时候加一个'&'实现这个目的. 如: tianfang > run &    [1] 11319t

为了解决性能问题,你登入了一台Linux服务器,在最开始的一分钟内需要查看什么? 在Netflix我们有一个庞大的EC2 Linux集群,还有非常多的性能分析工具来监控和调查它的性能.其中包括用于云监控的Atlas,用于实例按需分析的Vector.即使这些工具帮助我们解决了大多数问题,我们有时还是得登入Linux实例,运行一些标准的Linux性能工具来解决问题. 在这篇文章里,Netflix Performance Engineering团队将使用居家常备的Linux标准命令行工具,演示在性能调

下面是内存篇章的学习笔记,部分内容与前面的性能优化典范有重合,欢迎大家一起学习交流! 1)Memory, GC, and Performance 众所周知,与C/C++需要通过手动编码来申请以及释放内存有所不同,Java拥有GC的机制.Android系统里面有一个Generational Heap Memory的 模型,系统会根据内存中不同的内存数据类型分别执行不同的GC操作.例如,最近刚分配的对象会放在Young Generation区域,这个区域的对象通常都是会快速被创建并且很快被销毁回收的

阅读目录 0)Render Performance 1)Understanding Overdraw 2)Understanding VSYNC 3)Tool:Profile GPU Rendering 4)Why 60fps? 5)Android, UI and the GPU 6)Invalidations, Layouts, and Performance 7)Overdraw, Cliprect, QuickReject 8)Memory Churn and performance 9)

转载自oschina. 2015年伊始,Google发布了关于Android性能优化典范的专题, 一共16个短视频,每个3-5分钟,帮助开发者创建更快更优秀的Android App.课程专题不仅仅介绍了Android系统中有关性能问题的底层工作原理,同时也介绍了如何通过工具来找出性能问题以及提升性能的建议.主要从三个 方面展开,Android的渲染机制,内存与GC,电量优化.下面是对这些问题和建议的总结梳理. 0)Render Performance 大多数用户感知到的卡顿等性能问题的最主要根源

Beautiful Soup 是一个可以从HTML或XML文件中提取数据的Python库.它能够通过你喜欢的转换器实现惯用的文档导航,查找,修改文档的方式.Beautiful Soup会帮你节省数小时甚至数天的工作时间. 这篇文档介绍了BeautifulSoup4中所有主要特性,并切有小例子.让我来向你展示它适合做什么,如何工作,怎样使用,如何达到你想要的效果,和处理异常情况. 文档中出现的例子在Python2.7和Python3.2中的执行结果相同 你可能在寻找 Beautiful Soup3

Ⅰ.功能: .创建图 .展示全图 .添加顶点 .添加边 .删除顶点 .删除边 .查看指定边权值 .修改指定边权值 .输出两点间的所有简单路及路径对应权值 .销毁图 ps:关于9,如果不存在任何简单路,输出“不存在任何简单路”.简单路:不含重复顶点的路.如 5是简单路, 5不是简单路.可以想见,对于大多数问题,非简单路是没有 研究意义的.如从北京到上海的路线,多次经过同一地点的路线是没有研究价值的. Ⅱ.不足: .代码冗长,复用率低.原因是有些操作基本相同但又有细微不同(如goto mark6;g

http://blog.csdn.net/leonwei/article/details/48009059 Unity5带来的最大的改变就是全新的GI,在烘焙引擎上抛弃了4的beast,使用了虚幻采用的Enlighten,引入了实时的全局光.这里对UNITY5的新的光照系统做一总结. 新加入了一种只用于烘焙的光照类型 Area Light 面积光的光源有形状,是一个矩形区域,有位置,有方向,方向是超矩形的一面,矩形的背面没有光,并且随距离衰减直到没有.它用于模拟大量的光源和在一起的效果,如街道,