java -jar /home/liuhui/bin/trinityrnaseq_r20140413p1/trinity-plugins/Trimmomatic/trimmomatic.jar PE -threads 20 -phred33 P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz \
P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.P.qtrim P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.U.qtrim P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.P.qtrim P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.U.qtrim SLIDINGWINDOW:4:5 LEADING:5 TRAILING:5 MINLEN:25 cat P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.P.qtrim P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.U.qtrim > P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.PwU.qtrim.fq
cat P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.P.qtrim P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.U.qtrim > P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.PwU.qtrim.fq gzip P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.P.qtrim P_ACAGTG_L002_R1_001.fastq.gz.U.qtrim P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.P.qtrim P_ACAGTG_L002_R2_001.fastq.gz.U.qtrim &

最新文章

  1. CentOS7下安装Tomcat
  2. js对汉字首字母排序
  3. razor GPU
  4. .gitignore规则不生效的解决办法
  5. ArrayList与List对象用法与区别
  6. 使用entity framework开发oracle
  7. DDctf 新得
  8. 虚拟机下Ubuntu扩容及磁盘重新分区-Gparted
  9. web-worker 的使用
  10. Reactor 3 学习笔记(2)
  11. 解决工作中遇到的一个"打开,保存"文件框的bug的过程
  12. slf4j + log4j 是如何初始化的
  13. Ubuntu14.04安装Torch7笔记
  14. vo、po、dto、bo、pojo、entity、mode如何区分
  15. SPOJ 3267. D-query (主席树,查询区间有多少个不相同的数)
  16. Android 面试题(答案最全)
  17. vs2013\2015-UML
  18. Oracle数据库学习(四):学习中的遇到的问题
  19. PLAN OF HEOI(unfinished)
  20. 关于Java中SQL语句的拼接规则

热门文章

  1. PAT 1003. 我要通过!(20)
  2. WEBAPI 怎么保证安全
  3. Iptables 报错Couldn't load target `ACCET':/lib64/xtables/libipt_ACCET.so: cannot open shared object file
  4. eap
  5. img加载在IE11,chrome,FF下的不同
  6. python数字图像处理(18):高级形态学处理
  7. 直流调速系统Modelica基本模型
  8. ICSharpCode.SharpZipLib
  9. CUDA2.3-原理之任意长度的矢量求和与用事件来测量性能
  10. CodeIgniter框架入门教程——第三课 URL及ajax