使用R的networkD3包画可交互的网络图
d3network包
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pre:not([class]) {
background-color: white;
}
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margin-right: auto;
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padding-top: 12px;
}
button.code-folding-btn:focus {
outline: none;
}
d3network包
ShangFR
2016年5月6日
R d3network包
通过Christopher Gandrud编写的d3network包可以轻松创建基于Htmlwidgets框架的网络图。它目前支持三种类型的网络图:
- 力导向图,可以显示复杂的网络划分关系;
- 桑基图(Sankeydiagram),利于展现分类维度间的相关性,以流的形式呈现共享同一类别的元素数量。特别适合表达集群的发展,比如展示特定群体的人数分布等;
- Reingold-Tilford树型图,可以把一个树形结构的数据,用不重叠、紧凑、分层的形式展示出来。
下面通过例子展示这三种类型的网络图。
力导向图
首先载入networkD3包,然后创建src源、target目标两个向量,整合成数据框networkData,最后就可以通过simpleNetwork函数画出一个简单的力导向图(见例1);此外,也可以通过自有数据框MisLinks、MisNodes创建复杂一点的力导向图(见例2)。
#例1
# 载入软件包
library(networkD3)
创建数据
src <- c("A", "A", "A", "A",
"B", "B", "C", "C", "D")
target <- c("B", "C", "D", "J",
"E", "F", "G", "H", "I")
networkData <- data.frame(src, target, zoom = TRUE)
画图
simpleNetwork(networkData)
#例2
# 直接载入数据包(数据框)
data(MisLinks)
data(MisNodes)
画图
forceNetwork(Links = MisLinks, Nodes = MisNodes,
Source = "source", Target = "target",
Value = "value", NodeID = "name",
Group = "group", opacity = 0.8, zoom = TRUE)
桑基图(Sankeydiagram)
桑基图(Sankeydiagram),利于展现分类维度间的相关性,以流的形式呈现共享同一类别的元素数量。特别适合表达集群的发展,比如展示特定群体的人数分布等;可以直接使用网上下载的JSON数据创建桑基图,例子如下:
Reingold-Tilford树型图
RT树型图可以把一个树形结构的数据,用不重叠、紧凑、分层的形式展示出来。
URL <- paste0(
"https://cdn.rawgit.com/christophergandrud/networkD3/",
"master/JSONdata//flare.json")
格式转化
Flare <- jsonlite::fromJSON(URL, simplifyDataFrame = FALSE)
使用部分数据1-3
Flare\(children = Flare\)children[1:3]
环形的RT树,如下图:
radialNetwork(List = Flare, fontSize = 10, opacity = 0.9)
#直接生成一棵从左到右的树,如下图:
diagonalNetwork(List = Flare, fontSize = 10, opacity = 0.9)
反馈与建议
- 作者:ShangFR
- 邮箱:shangfr@foxmail.com
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