insert size|single-read|Paired-end|Mate-pair
2024-09-07 17:39:39
（测序方面）：测三只大熊猫；得到的insert size有150bp，500bp，2kb，5kb和10kb这四种，可测得序列长度和平均reads长度。
为什么average reads这么短？
因为insert size是打断前的长度，打断之后便是reads，这里计算average reads长度。
shotgun sequencing鸟枪法：直接从生物细胞基因组中获取目的基因的方式
single-read ：单端测序（200-500bp）
Paired-end ：双末端测序（200-500bp）因为双末端测序，所以中间被测序列称为insert，insert 打断了之后的片段就是reads。
Mate-pair ：（2000-10000bp）：用来生成确定基因中reads位置的短片段（end）。将一类长序列打断成特定大小（只要小于长片段长度即可），之后采用化学方式将其修复（环化等），同时在两端加入生物素标记（这是为了下一次在长序列中标记位置所做的准备），再将这些环化后的序列打碎，捕获具有生物标记的片段。现在已知长序列的长度，和长序列两端的小序列内容，可以定位出该小序列在基因组上的位置，以便后期装入pair-end reads。
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