Linkage Disequilibrium|D‘|r2
2024-08-28 21:08:02
I.10 Other Measures of Linkage Disequilibrium
因为D的取值强烈地依赖于人为制定的等位基因频率(PA及PB),所以它不利于LD程度的比较。标准化的不平衡系数D'能够避免这种对等位基因频率的依赖。D'的计算方法如下:
D'=D/Dmax
这样使得-1<D<1
但当其他所有概率保持不变,当D取分别取正值或负值时,D’值会有所改变,这说明D’在经历0点时会发生变化。
所以,在此加入相关系数r,推导如下:
若相关系数为0,则证明两者独立。
所以,当PA=PB时,相关系数可能为-1或1。
以上这些估计方法通常综合使用。
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