本文首发于微信公众号“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/A5nqo6qnlt_5kF3_GIrjIA

学习了ggplot2|详解八大基本绘图要素后，就可以根据自己的需要绘制图形。前面也给出了一些ggplot2绘制生信分析基本图形的例子

pheatmap|暴雨暂歇，“热图”来袭！！！

ggplot2-plotly|让你的火山图“活”过来

ggplot2|扩展包从0开始绘制雷达图

ggplot2| 绘制KEGG气泡图

ggplot2|绘制GO富集柱形图

ggplot2|从0开始绘制PCA图

ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并

本文将介绍一些对legend的细节操作来完成图形的“精雕细琢”。

载入R包和数据

mtcars数据集作为示例数据

library(ggplot2)#查看数据集

head(mtcars)

# 将cyl gear变量转为因子变量

mtcars$cyl<-as.factor(mtcars$cyl)

mtcars$gear <- as.factor(mtcars$gear)

绘制基本图形

#gear为横坐标，对mpg做箱线图，gear填充颜色

p <- ggplot(mtcars, aes(x=gear, y=mpg, fill=gear)) + geom_boxplot()

p

设置 legend position

使用 theme() 参数设置legend位置

# 可选参数为“left”,“top”, “right”, “bottom”.

p + theme(legend.position="bottom")

# 数值向量 c(x,y) 调控位置

p + theme(legend.position = c(0.8, 0.2))

aaarticlea/gif;base64,iVBORw0KGgoAAAANSUhEUgAAAAEAAAABCAYAAAAfFcSJAAAADUlEQVQImWNgYGBgAAAABQABh6FO1AAAAABJRU5ErkJggg==" alt="img" />

更改legend 的title ， font styles

# legend title

p + theme(legend.title = element_text(colour="blue", size=10,                                     face="bold"))

# legend labels

p + theme(legend.text = element_text(colour="blue", size=10,                                    face="bold"))

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设置 legend 背景色

#fill设置legend box背景色，colour设置边框颜色

p + theme(legend.background = element_rect(fill="lightblue",                                 size=0.5, linetype="solid",

    colour ="darkblue"))

设置legend items顺序

scale_x_discrete自定义设置顺序

p + scale_x_discrete(limits=c("3", "5", "4"))

去除legend

# 去除legend title

p + theme(legend.title = element_blank())

# 去除整个legend

p + theme(legend.position='none')

guides 设置specific aesthetic

使用guides()参数来设置或移除特定的美学映射(fill, color, size, shape等).
因子变量cyl和gear映射为点图的颜色和形状，qsec决定点的大小。

p <- ggplot(data = mtcars,   aes(x=mpg, y=wt, color=cyl, size=qsec, shape=gear))+   geom_point()

# 不设定specific aesthetic时候

p

设置多个legend的位置

# 更改 legend position

p +theme(legend.position="bottom")

# Horizontal legend box

p +theme(legend.position="bottom", legend.box = "")

设置multiple guides顺序

使用 guide_legend() 参数：

p+guides(color = guide_legend(order=1),        size = guide_legend(order=2),        shape = guide_legend(order=3))

去除particular aesthetic

通过设置FALSE，可不展示对应的legend

p+guides(color = FALSE)

也可以使用scale_xx.函数去掉特定的legend

# Remove legend for the point shape

p+scale_shape(guide=FALSE)

# Remove legend for size

p +scale_size(guide=FALSE)

# Remove legend for color

p + scale_color_manual(values=c('#999999','#E69F00','#56B4E9'),                      guide=FALSE)

通过以上参数的设置即完成对所绘制图形的legend的细节修改，得到自己所需要的图形。

参考资料：http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-legend-easy-steps-to-change-the-position-and-the-appearance-of-a-graph-legend-in-r-software