geneid/genesymbol/ensemblid等之间的转换
2024-08-28 11:30:48
在基因注释时,难免碰到各种GENE在不同数据库之间的ID转换(例如,Ensembl ID 转Entrez ID,或者Entrez ID与GENE Symbol之间的转换)。这里介绍一下常用的三个在线网站, DAVID、bioDBnet、Ensembl Biomart, DAVID访问太慢,Ensembl Biomart参数配置太麻烦,推荐使用bioDBnet。
bioDBnet RESET API
bioDBnet除支持web在线转换外,还提供了RESET API接口,允许程序语言(python、perl、R等)进行访问。
参考资料
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