ADNI数据集相关概念整理

2024-10-12 03:58:35

数据类型

临床
遗传
MRI图像
PET图像
生物样本

临床

ADNI临床数据集包括关于每个受试者的临床信息，包括招募，人口统计学，身体检查和认知评估数据。可以将整套临床数据作为逗号分隔值（CSV）文件批量下载。
ADNI临床数据由阿尔茨海默氏症治疗研究所（ATRI）收集和管理。
下表总结了收集的临床数据

遗传

遗传因素在阿尔茨海默病中起重要作用。因此，ADNI的一个关键目标是为研究人员提供将遗传学与成像和临床数据相结合的机会，以帮助研究疾病的发病机制。已经为ADNI 1，ADNI GO和ADNI 2受试者生成了基因分型和测序数据，并且可供ADNI研究人员使用。
可用数据摘要如下：
基因数据: ILLUMINA SNP基因分型检测

ADNI的一个关键目标就是为研究人员提供机会，将遗传学、影像学和临床数据结合起来，帮助研究该病的机制
SNPs -- 单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms）
GWAS -- 全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies）
WGS -- 全基因组测序
APOE的4等位基因是已知的AD最强大的遗传风险因素，如果拥有一个4等位基因的人患AD的风险增加了2- 3倍，那么如果有两个等位基因的人患AD的风险增加了12倍。
GWAS采用标记物(单核苷酸多态性(SNPs))和感兴趣的表型之间的关联测试。病例对照GWAS和其他类型的遗传关联研究的结果可以为检测ADNI成像和其他生物标志物数据集派生的定量表型提供靶点。

MRI图像

MRI图像-磁共振成像，英文全称是：Magnetic Resonance Imaging，包括：原始、预处理和后处理的图像文件，FMRI和DTI。
MRI图像的收集对于满足ADNI开发生物标记物以追踪阿尔茨海默病的进展和潜在病理学变化的目标至关重要。
下表显示了整个ADNI研究中收集的MRI数据的概述

PET图像

PET：正电子发射型计算机断层显像（Positron Emission Computed Tomography），是核医学领域比较先进的临床检查影像技术。
PET图像的收集对于满足ADNI开发生物标记物以追踪阿尔茨海默病的进展和潜在病理学变化的目标至关重要。
下表为收集到的数据：
可用数据图像

生物样本

ADNI的目标之一是收集参与者的血液，尿液和脑脊液（CSF）等生物样本。
各阶段提取的生物样本

ADNI 1 BIOSPECIMEN COLLECTION
ADNI GO BIOSPECIMEN COLLECTION
ADNI 2 BIOSPECIMEN COLLECTION

相关名词解释

CSF-脑脊髓液（Cerebrospinal Fluid）
Plasma from Blood-血浆
Serum from Blood-血清
Buffy Coat-白细胞层

参考文献：

http://adni.loni.usc.edu/

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